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J-GLOBAL ID：201802287753776671   整理番号：18A0787492

環境ストレスに対するLactococcus lactisの初期トランスクリプトーム応答は特異的に発現された小調節RNAとtRNAを明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Early Transcriptome Response of Lactococcus lactis to Environmental Stresses Reveals Differentially Expressed Small Regulatory RNAs and tRNAs

著者 (6件)： van der Meulen Sjoerd B. (Department of Molecular Genetics, Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute, University of Groningen) ,  van der Meulen Sjoerd B. (Top Institute Food and Nutrition) ,  de Jong Anne (Department of Molecular Genetics, Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute, University of Groningen) ,  de Jong Anne (Top Institute Food and Nutrition) ,  Kok Jan (Department of Molecular Genetics, Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute, University of Groningen) ,  Kok Jan (Top Institute Food and Nutrition)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 1704  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細菌は環境ストレスに対抗する様々な機構を展開できる。多くの遺伝子は以前Lactococcus lactisにおいて同定されており,ストレス因子の検出に関与しており,ストレスのある条件に対する防御を制御し,実装することに関与している。しかし,工業的に関連するストレス条件の間の小調節RNA(sRNA)の発現はL.lactisではまだ評価されていないが,sRNAは他の細菌における多くのストレス応答に関与していることが示されている。我々は以前にL.lactisにおける数百の推定制御RNAの存在を報告し,6つの異なるストレス条件下でのそれらの発現を評価するために,本研究において高スループットRNA配列決定(RNA-seq)を用いた。均一に設計された実験装置は,異なるストレス応答の間の非常に信頼できる比較を可能にし,多くのsRNAが適用された条件下で差別的に発現されることを明らかにした。L.lactis NCDO712の一次ストレス応答は,以前の研究に対してベンチマークされ,最初に,異なる発現が,NCDO712の6つの最近配列されたプラスミドからの転写RNA(tRNA)と遺伝子の評価された。5分間のストレスのみを適用したが,良く知られた特異的ストレス誘導遺伝子の大部分は既に差別的に発現していた。ほとんどのtRNAは,低温ストレスで増加する少数を除いて,適用した全てのストレス後に減少することを見出した。飢餓は,遺伝子の数と発現レベルの両方において,最も高い微分応答を誘導することが示された。著者らのデータは,多くの新しいストレス関連の非特性化遺伝子およびsRNAを指摘し,それらの分子および細胞機能のさらなる評価を必要とする。さらに,これらの洞察は,非常に短いストレス条件が遺伝子発現を大きく変えることを見出すように,細菌培養生産と乳発酵のために設計された方法パラメータに影響を与える可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *tRNA ,  *トランスクリプトーム ,  発酵 ,  プラスミド ,  遺伝子発現 ,  遺伝子 ,  寒冷ストレス ,  *RNA【核酸】 ,  *乳酸連鎖球菌 ,  キャラクタリゼーション
準シソーラス用語： 細菌培養 ,  ハイスループット ,  ストレス応答 ,  低分子RNA ,  *環境ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： RNA-seq ,  SRNAS ,  トランスクリプトーム ,  環境ストレス ,  L.lactis

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  微生物生理一般  (EG03051L)

タイトルに関連する用語 (9件)： 環境ストレス ,  Lactococcus ,  初期 ,  トランスクリプトーム ,  応答 ,  発現 ,  調節 ,  RNA ,  tRNA