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J-GLOBAL ID：201802288078516078   整理番号：18A0790591

tRNAとそれらのそれぞれのアミノアシルtRNAシンテターゼ間の結合表面の構造的および進化的データに基づく系統的解析【JST・京大機械翻訳】

Systematic Analysis of the Binding Surfaces between tRNAs and Their Respective Aminoacyl tRNA Synthetase Based on Structural and Evolutionary Data

著者 (10件)： Tamaki Satoshi (Institute for Advanced Biosciences, Keio University) ,  Tamaki Satoshi (Systems Biology Program, Graduate School of Media and Governance, Keio University) ,  Tomita Masaru (Institute for Advanced Biosciences, Keio University) ,  Tomita Masaru (Systems Biology Program, Graduate School of Media and Governance, Keio University) ,  Tomita Masaru (Faculty of Environment and Information Studies, Keio University) ,  Suzuki Haruo (Institute for Advanced Biosciences, Keio University) ,  Suzuki Haruo (Faculty of Environment and Information Studies, Keio University) ,  Kanai Akio (Institute for Advanced Biosciences, Keio University) ,  Kanai Akio (Systems Biology Program, Graduate School of Media and Governance, Keio University) ,  Kanai Akio (Faculty of Environment and Information Studies, Keio University)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 8  ページ： 227  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝情報の流れの基礎となる機構を決定するために,tRNAとその結合酵素(アミノアシルtRNAシンテターゼ(aaRS)ファミリーのメンバー)の間の関係を理解することが重要である。三次元構造から得られたtRNA-aaRS複合体の相互作用領域を二次元空間上に投影する新しい方法を開発した。各tRNAとそのaaRSの間の相互作用表面は,3.3Åの原子距離閾値とのこれらの相互作用を決定することにより,成功裏に同定された。60の主に細菌と真核生物のtRNA-aaRS複合体を用いてそれらの相互作用を解析し,各aaRSと最も強く相互作用するtRNA配列領域はアンチコドンループとCCA末端領域であり,次いでD-ステムであることを示した。正準tRNAの配列保存分析を,83の細菌,182の古細菌,および150の真核生物種において行った。著者らの結果は,tRNA L型構造の形成に重要であることが知られているaaRSおよび2つの付加的ループ領域(DループおよびTψCループ)と相互作用する3つのtRNA領域が広く保存されていることを示している。著者らはまた,細菌と古細菌におけるtRNA識別子の近くの配列保存と,真核生物における膨大な数の非標準的tRNAを見出した。これは,その構造と前例のない数の配列データに基づくtRNA進化の最初のグローバルな見解である。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 複合体 ,  リガーゼ ,  分子進化 ,  *RNA【核酸】 ,  タンパク質複合体 ,  相互作用 ,  古細菌 ,  遺伝情報 ,  *アミノアシルtRNAシンテターゼ ,  細菌 ,  真核生物 ,  *tRNA ,  二次元
準シソーラス用語： Dループ ,  三次元構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： tRNA ,  アミノアシルtRNAシンテターゼ ,  RNA-蛋白質複合体 ,  相互作用する表面 ,  分子進化

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： tRNA ,  アミノアシルtRNAシンテターゼ ,  進化 ,  系統 ,  解析