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J-GLOBAL ID：201802288536978452   整理番号：18A0819529

中国の2つのチベット-バーメース少数民族における165祖先情報SNPsの超並列配列決定【JST・京大機械翻訳】

Massively parallel sequencing of 165 ancestry informative SNPs in two Chinese Tibetan-Burmese minority ethnicities

著者 (10件)： Wang Zheng (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Medical Sciences & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu 610041, China) ,  He Guanglin (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Medical Sciences & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu 610041, China) ,  Luo Tao (Laboratory of Infection and Immunity, West China School of Preclinical and Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu 610041, China) ,  Zhao Xueying (Shanghai Key Laboratory of Crime Scene Evidence, Shanghai Research Institute of Criminal Science and Technology, Shanghai 200083, China) ,  Liu Jing (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Medical Sciences & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu 610041, China) ,  Wang Mengge (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Medical Sciences & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu 610041, China) ,  Zhou Di (Thermo Fisher Scientific, Shanghai 200050, China) ,  Chen Xu (Department of Clinical Laboratory, the First People’s Hospital of Liangshan Yi Autonomous Prefecture, Xichang, Sichuan 615000, China) ,  Li Chengtao (Shanghai Key Laboratory of Forensic Medicine, Institute of Forensic Science, Ministry of Justice, Shanghai 200063, China) ,  Hou Yiping (Institute of Forensic Medicine, West China School of Basic Medical Sciences & Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu 610041, China)
資料名： Forensic Science International: Genetics  (Forensic Science International: Genetics)
巻： 34  ページ： 141-147  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3148A  ISSN： 1872-4973  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Sino-チベット言語の1つのサブファミリーであるチベット-バーマン言語は,東アジア全体で60万人以上の人々によって話されている。しかし,チベットからバーマンへの個体群の民族起源と遺伝的アーキテクチャはほとんど研究されていない。本研究において,中国西部の4つの異なる地理的地域におけるチベットからバーマンの個体群(2つの民族群:チベットとYi)からの169人の中国人を,精密ID Ancestry Panel(165AISNP)とIon PGMシステムを用いて分析した。このAISNPパネルの性能と対応する法医学統計パラメータを調べた。包括的な個体群遺伝的比較(KiddのSNPに基づく143の個体群,SeldinのSNPに基づく92の個体群,およびPrecision ID Ancestry Panelに基づく31の個体群)と祖先の推論をさらに実行した。シーケンス性能は,精密ID Ancestry Panelが効果的でロバストであることを示した。法医学的特性は,このパネルが,チベットからバーマン個体群の祖先推定に使用できるだけでなく,個々の同定にも使用できることを示唆した。チベットとYiは,一般的な遺伝的祖先起源を共有したが,遺伝子流動,局所適応,および分離の複雑な歴史を経験し,高地とLowlander個体群のヒト遺伝的多様性の特異的遺伝的景観を構築した。チベット-ブルマン個体群と他の東アジア個体群は十分な遺伝的差異を示し,3つの異なるグループに区別できた。さらに,個体群構造の分析により,有意な遺伝的差異が大陸間個体群に存在し,強い遺伝的親和性が大陸内個体群に観察されたことを明らかにした。付加的な集団特異的AISNPと十分な参照集団データによる比較的包括的なデータベースは,東アジアにおける地理的に近似的な集団内でより良いスケールの分解能を得るために必要とされている。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 親和性 ,  遺伝 ,  *民族 ,  分解能 ,  ヒト ,  言語 ,  地理学 ,  個体群 ,  近似法 ,  法医学 ,  データベース ,  *一塩基多型 ,  *チベット自治区 ,  ロバスト性
準シソーラス用語： 個体群構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 超並列シークエンシング(MPS) ,  イオンPGMシステム ,  祖先推論 ,  正確なIDの祖先パネル ,  チベット-ビルメーズ

分類 (3件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  進化論一般  (EC03010Q) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (4件)： 中国 ,  チベット ,  少数民族 ,  SNPs