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J-GLOBAL ID:201802289015932119   整理番号:18A1191302

仮説開発のための公共,ゲノムワイド,マウス好酸球発現データの再利用【JST・京大機械翻訳】

Reuse of public, genome-wide, murine eosinophil expression data for hypotheses development
著者 (7件):
資料名:
巻: 104  号:ページ: 185-193  発行年: 2018年 
JST資料番号: A0832B  ISSN: 0741-5400  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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好酸球(Eos)表面表現型および活性化状態は,組織への動員および炎症性サイトカインへの曝露後に変化する。加えて,異なるEos機能サブセットが記述され,Eosに対する組織特異的反応が器官ホメオスタシスに寄与することを示唆した。Eosサブセットがそれらの組織特異的同一性を達成する機構を理解することは,現在,好酸球研究コミュニティにとっての目標となっていない。公的に保存された表現データは,オリジナルの質問,テスト,および新しい仮説を作り出すために使用され,実験計画のための発射点として役立つ。これらの目標を念頭において,遺伝的背景,培養方法,および組織耐性がマウスEos遺伝子発現に及ぼす影響を,公開されているゲノム全体の発現データを用いて調べた。培養から分化したEOSは,天然ホメオスタシスEosのそれとは異なる遺伝子発現プロファイルを有する;したがって,研究者は,関心のあるそれらの遺伝子を研究するために適切な培養法を選択することを助けるために公表された発現データを再利用することができる。加えて,Eos lung-および胃腸特異的トランスクリプトームを同定し,恒常性においてさえ末端分化した顆粒球における遺伝子発現に対する局所組織環境の重大な影響を強調した。公開データ再利用を含むEos研究者の「ツールボックス」を拡張することは,冗長性を減らし,研究効率を増加させ,新しい生物学的洞察をもたらすことができる。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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遺伝子発現 

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