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J-GLOBAL ID：201802289222912650   整理番号：18A1198188

2014年から2015年までの中国南部における11種のブタ繁殖および呼吸器症候群ウイルス分離株の遺伝的特性化【JST・京大機械翻訳】

Genetic characterization of 11 porcine reproductive and respiratory syndrome virus isolates in South China from 2014 to 2015

著者 (10件)： Yu Linyang (College of Animal Science & National Engineering Center for Swine Breeding Industry, South China Agriculture University, Guangzhou, China) ,  Zhao Pandeng (College of Animal Science & National Engineering Center for Swine Breeding Industry, South China Agriculture University, Guangzhou, China) ,  Zhao Pandeng (Henan University of Animal Husbandry and Economy, Zhengzhou, China) ,  Dong Jianguo (College of Animal Science & National Engineering Center for Swine Breeding Industry, South China Agriculture University, Guangzhou, China) ,  Dong Jianguo (College of Animal Husbandry and Veterinary, Xinyang Agriculture and Forestry University, Xinyang, China) ,  Liu Yanling (College of Animal Science & National Engineering Center for Swine Breeding Industry, South China Agriculture University, Guangzhou, China) ,  Zhang Leyi (College of Animal Science & National Engineering Center for Swine Breeding Industry, South China Agriculture University, Guangzhou, China) ,  Liang Pengshuai (College of Animal Science & National Engineering Center for Swine Breeding Industry, South China Agriculture University, Guangzhou, China) ,  Wang Lei (College of Animal Science & National Engineering Center for Swine Breeding Industry, South China Agriculture University, Guangzhou, China) ,  Song Changxu (College of Animal Science & National Engineering Center for Swine Breeding Industry, South China Agriculture University, Guangzhou, China)
資料名： Virology Journal (Web)  (Virology Journal (Web))
巻： 14  号： 1  ページ： 139  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7347A  ISSN： 1743-422X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ブタ生殖および呼吸器症候群(PRRS)は,ブタ産業に対して1年当たり膨大な損失をもたらし,その病因ブタ生殖および呼吸器症候群ウイルス(PRRSV)はブタにおいて高度に変異したウイルスである。中国南部におけるPRRSVゲノムの遺伝的特性を完全に理解するために,本研究は2014年から2015年まで広東省および海南省におけるPRRSVに感染した肺サンプルを収集し,PRRSVを分離することを試みた。最後に,分離株の完全ゲノムを配列決定し,分析した。【方法】ウイルス分離をMARC-145細胞で行った。PRRSVゲノムの13フラグメントをRT-PCRにより増幅し,完全PRRSVゲノム配列をDNASTAR7.0ソフトウェアのSeqManプログラムにより得た。NSP2およびORF5のヌクレオチドおよび推定アミノ酸(AA)配列を,配列相同性を決定するためにDNASTAR7.0ソフトウェアのMegAlignプログラムを用いて整列させた。進化関係を分析するために,近隣結合法を用いてMEGA5.2ソフトウェアを用いて系統樹を構築した。結果:11のPRRSV株は,2014年から2015年まで中国南部で分離された。すべての分離株は,HP-PRRSV代表株JXA1,HuN4およびJXwn06とともにサブ遺伝子型Vにクラスター化した。サブ遺伝子型Vは,2つの群にさらに分けられた。AA配列アラインメント分析は,すべての分離株が,位置481および533-561において,1AA欠失および29AA連続欠失を有することを示した。特に,GDHY株は,629-748の位置で別の120AA連続欠失を有した。全ての分離株は,ワクチン株を区別すると考えられるGP5の残基A137においてA137S変異を有していた。全ての分離株はGP5の一次中和エピトープ(PNE)にL39I変異を有していた。GDHZを除いて,N34T突然変異があり,他の分離株のすべては,GP5の4つの潜在的N-グリコシル化部位(N30,N34,N44およびN51)において保存されたN30,N44およびN51グリコシル化部位を持っていた。結論:著者らの研究は,この領域における一般的な株が高度に病原性のPRRSウイルス様であることを示した。さらに,NSP2領域における不連続な30(29+1)アミノ酸欠失を除いて,別の120アミノ酸連続欠失を有する1つの新しい株が出現した。さらに,分離株は,GP5の推定シグナル,外ビリオンおよびビリオン内領域において広範なアミノ酸置換を有していた。これらの結果は,PRRSVが中国南部において広範囲の変動を受けたことを示し,この地域におけるPRRSVをより良く制御するための効果的なワクチンを研究するためのいくつかの理論的基礎を提供した。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  ビリオン ,  グリコシル化 ,  クラスタ化 ,  エピトープ ,  ゲノム ,  遺伝子型 ,  系統樹 ,  RT-PCR法 ,  *中国南部 ,  ワクチン ,  突然変異 ,  ソフトウェア
準シソーラス用語： *分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： PRRSV ,  系統発生解析 ,  NSP2 ,  GP5 ,  突然変異

分類 (1件)： ウイルスによる動物の伝染病  (FE02024R)

引用文献 (29件)：

• J Am Vet Med Assoc; Assessment of the economic impact of porcine reproductive and respiratory syndrome on swine production in the United States; EJ Neumann, JB Kliebenstein, CD Johnson, JW Mabry, EJ Bush, AH Seitzinger, AL Green, JJ Zimmerman; 227; 2005; 385-392; 10.2460/javma.2005.227.385; CR1;
• J Vet Diagn Investig; Characterization of swine infertility and respiratory syndrome (SIRS) virus (isolate ATCC VR-2332); DA Benfield, E Nelson, JE Collins, L Harris, SM Goyal, D Robison, WT Christianson, RB Morrison, D Gorcyca, D Chladek; 4; 1992; 127-133; 10.1177/104063879200400202; CR2;
• Vet Q; Mystery swine disease in The Netherlands: the isolation of Lelystad virus; G Wensvoort, C Terpstra, JM Pol, EA Laak, M Bloemraad, EP Kluyver, C Kragten, L Buiten, A Besten, F Wagenaar, A Et; 13; 1991; 121-130; 10.1080/01652176.1991.9694296; CR3;
• Emerg Infect Dis; Highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome virus, Asia; TQ An, ZJ Tian, CL Leng, JM Peng, GZ Tong; 17; 2011; 1782-1784; 10.3201/eid1709.110411; CR4;
• J Vet Diagn Investig; Emergence and pathogenicity of highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome virus in Vientiane, Lao People's Democratic Republic; J Ni, S Yang, D Bounlom, X Yu, Z Zhou, J Song, V Khamphouth, T Vatthana, K Tian; 24; 2012; 349-354; 10.1177/1040638711434111; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： 中国南部 ,  ブタ ,  繁殖 ,  呼吸器 ,  症候群 ,  ウイルス ,  分離株 ,  遺伝的特性化