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J-GLOBAL ID：201802290174090404   整理番号：18A0787289

ジャガイモ根浸出液に応答したBacillus mycoides株の比較トランスクリプトームは内生および土壌分離株の異なる遺伝的適応を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comparative Transcriptomics of Bacillus mycoides Strains in Response to Potato-Root Exudates Reveals Different Genetic Adaptation of Endophytic and Soil Isolates

著者 (4件)： Yi Yanglei (Molecular Genetics Department, Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute, University of Groningen) ,  de Jong Anne (Molecular Genetics Department, Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute, University of Groningen) ,  Frenzel Elrike (Molecular Genetics Department, Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute, University of Groningen) ,  Kuipers Oscar P. (Molecular Genetics Department, Groningen Biomolecular Sciences and Biotechnology Institute, University of Groningen)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 1487  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 植物根分泌化合物は,それぞれ有益または有害な種との相互作用を刺激するかまたは反復するシグナル分子として作用することにより,関連微生物の遺伝子発現を変化させる。しかしながら,2つの異なるグループの有益な細菌,非植物関連(土壌)株および植物関連(内部寄生)株が,根浸出液による曝露に対して均一または可変的に応答するかどうかはまだ不明である。したがって,潜在的生物防除剤および植物成長促進細菌であるBacillus mycoidesを,ジャガイモの内圏および同じ地理的地域の土壌から分離した。GFP標識B.mycoides株を接種された植物の共焦点蛍光顕微鏡は,内圏分離株EC18がより強い植物コロニー形成能を有し,土壌分離株SB8よりコロニー形成サイトに対してより成功裏に競合することを示した。これらの表現型差異を分析するために,2つの株のゲノムを配列決定し,ジャガイモ根浸出液に対するトランスクリプトーム応答を比較した。全体的トランスクリプトームプロファイルは,内部寄生性分離株が土壌由来分離株よりもより顕著に応答し,有意差次的発現遺伝子のより高い数が検出されたことを証明した。両分離株は,以前に植物-微生物相互作用に関与すると報告されている遺伝子の重複セットの発現の変化に応答した。有機物代謝,酸化還元及び膜貫通輸送を含む。特に,いくつかの遺伝子が内圏分離株EC18において特異的に上方制御され,一方,土壌分離株SB8において反対に下方制御された。これらの遺伝子は主に膜蛋白質,転写調節因子またはアミノ酸代謝と生合成に関与していた。対照的に,土壌分離株SB8においてアップレギュレートされ,内圏分離株EC18において下方制御されたいくつかの遺伝子は糖輸送に関連しており,これは2つの環境における異なる栄養素アベイラビリティと一致する可能性がある。まとめると,提示したトランスクリプトームプロファイルは,B.mycoidesの植物関連内生菌と土壌分離株の生命戦略への高度に改善された洞察を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 膜タンパク質 ,  生合成 ,  アップレギュレーション ,  ゲノム ,  生物農薬 ,  表現型 ,  *桿菌属 ,  相互作用 ,  *ジャガイモ ,  ダウンレギュレーション ,  栄養素 ,  遺伝子発現 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： コロニー形成 ,  *分離株 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Bacillus mycoides ,  エンドファイト ,  根のコロニー形成 ,  トランスクリプトーム ,  根浸出液

分類 (3件)： 土壌生物  (FB04050N) ,  生物的防除  (FC05030B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (9件)： ジャガイモ ,  根浸出液 ,  応答 ,  Bacillus ,  株 ,  トランスクリプトーム ,  土壌 ,  分離株 ,  適応