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J-GLOBAL ID：201802290436219216   整理番号：18A1200391

Rhodoferax antarcicus Ant.Brtのゲノム配列 南極微生物マットからの好psychroな紅色非硫黄細菌【JST・京大機械翻訳】

Genome Sequence of Rhodoferax antarcticus ANT.BRT; A Psychrophilic Purple Nonsulfur Bacterium from an Antarctic Microbial Mat

著者 (21件)： Baker Jennifer M. (Division of Natural Sciences, Indiana Wesleyan University, Marion, IN 46953, USA;) ,  Riester Carli J. (Division of Natural Sciences, Indiana Wesleyan University, Marion, IN 46953, USA;) ,  Skinner Blair M. (Division of Natural Sciences, Indiana Wesleyan University, Marion, IN 46953, USA;) ,  Newell Austin W. (Division of Natural Sciences, Indiana Wesleyan University, Marion, IN 46953, USA;) ,  Swingley Wesley D. (Department of Biological Sciences, Northern Illinois University, DeKalb, IL 60115, USA) ,  Madigan Michael T. (Department of Microbiology, Southern Illinois University, Carbondale, IL 62901, USA) ,  Jung Deborah O. (Department of Microbiology, Southern Illinois University, Carbondale, IL 62901, USA) ,  Asao Marie (Department of Microbiology, The Ohio State University, Columbus, OH 43210, USA) ,  Chen Min (School of Life and Environmental Sciences, The University of Sydney, New South Wales 2006, Australia) ,  Loughlin Patrick C. (School of Life and Environmental Sciences, The University of Sydney, New South Wales 2006, Australia) ,  Pan Hao (School of Life and Environmental Sciences, The University of Sydney, New South Wales 2006, Australia) ,  Lin Yuankui (School of Life and Environmental Sciences, The University of Sydney, New South Wales 2006, Australia) ,  Li Yaqiong (School of Life and Environmental Sciences, The University of Sydney, New South Wales 2006, Australia) ,  Shaw Jacob (Departments of Biology and Chemistry, Washington University in Saint Louis, St. Louis, MO 63130, USA) ,  Prado Mindy (Departments of Biology and Chemistry, Washington University in Saint Louis, St. Louis, MO 63130, USA) ,  Sherman Chris (Departments of Biology and Chemistry, Washington University in Saint Louis, St. Louis, MO 63130, USA) ,  Tang Joseph Kuo-Hsiang (Departments of Biology and Chemistry, Washington University in Saint Louis, St. Louis, MO 63130, USA) ,  Blankenship Robert E. (Departments of Biology and Chemistry, Washington University in Saint Louis, St. Louis, MO 63130, USA) ,  Zhao Tingting (School of Life Sciences, Arizona State University, Tempe, AZ 85287, USA) ,  Touchman Jeffrey W. (School of Life Sciences, Arizona State University, Tempe, AZ 85287, USA) ,  Sattley W. Matthew (Division of Natural Sciences, Indiana Wesleyan University, Marion, IN 46953, USA;)
資料名： Microorganisms (Web)  (Microorganisms (Web))
巻： 5  号： 1  ページ： 8  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7248A  ISSN： 2076-2607  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Rhodoferax antarcticaは南極の紫色の非硫黄細菌であり,20°C以下で最も良く成長する唯一の特性化された無酸素性光合成である。ここでは,南極の微生物マットから分離した,Rfx. antarctica 株ANT.BRTの高品質ドラフトゲノムを示した。Rfx.antarcticaの円形染色体(3.8Mbp)は59.1%グアニン+シトシン(GC)含量を有し,4036のオープンリーディングフレームを含んでいた。さらに,細菌は,全遺伝的含量の約5%を含む,siableプラスミド(198.6kbp,48.4%GC,226オープンリーディングフレームを含む)を含んでいた。驚くべきことに,集光性複合体1および3(LH1およびLH3)をコードする遺伝子は,紫色光合成細菌の間で独特の特徴であるRfx. antaricusゲノムの光合成遺伝子クラスターにおいて同定された。しかし,集光性複合体2(LH2)は同定されなかった。Rfx. antarcticaにおける窒素固定に対する強い能力を示す生理学的研究と一致して,モリブデン型ニトロゲナーゼをコードする窒素固定遺伝子クラスターが存在したが,この光刺激の低温活性表現型にもかかわらず,オルタナティブニトロゲナーゼは同定されなかった。リブロース1,5-ビスリン酸カルボキシラーゼ/オキシゲナーゼの2つの型をコードする遺伝子は,様々な環境条件下で独立栄養的柔軟性を提供する可能性のある特徴であるRfx. antaricusゲノムに存在した。最後に,IV型線毛と鞭毛の両方の集合のための遺伝子が存在し,後者はクラスタ化の異常な程度を示した。本報告は好冷性の無酸素性光合成の最初のゲノム解析を示し,永続的に寒冷ではあるが高度に変動する環境における光栄養的ライフスタイルを維持するための遺伝的基礎のglimpを提供する。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 窒素固定 ,  *南極 ,  プラスミド ,  *ゲノム ,  独立栄養 ,  遺伝 ,  クラスタ化 ,  表現型 ,  キャラクタリゼーション ,  光合成 ,  低温 ,  単供与体オキシゲナーゼ ,  光合成細菌 ,  *細菌
準シソーラス用語： オープンリーディングフレーム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 紫の酸素発生性光合成細菌 ,  光合成遺伝子クラスター ,  集光性複合体 ,  好psychro ,  南極大陸 ,  Rhodoferax antarcicus ,  窒素固定 ,  ニトロゲナーゼ

分類 (2件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

引用文献 (59件)：

• Madigan, M.T.; Jung, D.O. An overview of purple bacteria: Systematics, physiology, and habitats. In The Purple Phototrophic Bacteria; Hunter, C.N., Daldal, F., Thurnauer, C., Beatty, J.T., Eds.; Springer: Dordrecht, the Netherlands, 2009; Volume 28, pp. 1-15.
• Madigan, M.T. Anoxygenic phototrophic bacteria from extreme environments. Photosynth. Res. 2003, 76, 157-171.
• Madigan, M.T.; Jung, D.O.; Woese, C.R.; Achenbach, L.A. Rhodoferax antarcticus sp. nov., a moderately psychrophilic purple nonsulfur bacterium isolated from an Antarctic microbial mat. Arch. Microbiol. 2000, 173, 269-277.
• Morita, R.Y. Psychrophilic bacteria. Bacteriol. Rev. 1975, 39, 144-167.
• Jung, D.O.; Achenbach, L.A.; Karr, E.A.; Takaichi, S.; Madigan, M.T. A gas vesiculate strain of the purple non-sulfur bacterium Rhodoferax antarcticus isolated from Lake Fryxell, Dry Valleys, Antarctica. Arch. Microbiol. 2004, 182, 236-243.

タイトルに関連する用語 (4件)： BRT ,  ゲノム配列 ,  南極 ,  微生物マット