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J-GLOBAL ID：201802290719424173   整理番号：18A1154121

ラットモデルにおける中軸大腿骨骨折後の骨増殖に関連する潜在的遺伝子のスクリーニング【JST・京大機械翻訳】

Screening for potential genes associated with bone overgrowth after mid-shaft femur fracture in a rat model

著者 (4件)： Liu Chibing (The Second Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Liu Yanting (Jilin University, Changchun, China) ,  Zhang Weizhong (China-Japan Union Hospital of Jilin University, Changchun, China) ,  Liu Xiuxin (The Six Affiliated Hospital of Xinjiang Medical University Medical Examination Center, Urumqi City, China)
資料名： Journal of Orthopaedic Surgery and Research (Web)  (Journal of Orthopaedic Surgery and Research (Web))
巻： 12  号： 1  ページ： 8  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7520A  ISSN： 1749-799X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ハイスループットバイオインフォマティクスアプローチを用いて大腿骨骨折後の骨過剰成長の基礎となる分子機構を研究した。【方法】GSE3298(登録番号)の遺伝子発現プロファイルを遺伝子発現Omnibusデータベースから得た。破壊のない9つのサンプルと7つの時間ポイントのための7つの破壊サンプルを含む16の大腿成長プレートサンプルは,解析のために使用した。Limmaパッケージを適用して,破砕試料と無傷試料の間の差次的に発現した遺伝子(DEG)を同定した。DAVIDオンラインツールを,遺伝子オントロジー機能と経路濃縮分析のために使用した。Stringソフトウェアにより確立された蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークを用いて,有意なDEG間の相互作用を同定し,ネットワークモジュールをプラグインMCODEを用いて検出した。さらに,転写調節ネットワークをENCODEプロジェクトとPPIネットワークに基づいて構築した。【結果】合計680のDEGを,238の上方および442の下方制御された遺伝子を含む対照と比較して,骨折大腿成長プレートサンプルにおいてスクリーニングした。これらのDEGはカルシウムシグナル伝達経路と癌経路に有意に関与していた。PPIネットワークを167のノードと233のエッジで構築し,モジュール分析はCCL2,CSF2,NOS2,およびDLC1が抗アポトーシス関連機能を介して大腿骨骨折後の骨過剰成長を刺激する可能性を示した。転写調節ネットワークは387の相互作用対により構築され,重複するノードは細胞内シグナル伝達カスケードと細胞増殖の調節において有意に濃縮された。結論:Bone過剰成長は,大腿骨頭におけるCCL2,NOS2,CSF2およびDLC1のような同定されたDEGの発現の変化と関連していた。それらは骨芽細胞の抗アポトーシスを介して骨過剰成長を制御するのに重要である可能性がある。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  データベース ,  遺伝子発現 ,  *骨折 ,  *スクリーニング ,  細胞増殖 ,  骨芽細胞 ,  タンパク質 ,  相互作用 ,  ダウンレギュレーション ,  ソフトウェア ,  ネットワーク
準シソーラス用語： 抗アポトーシス作用 ,  蛋白質間相互作用 ,  *大腿骨骨折 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 大腿骨骨折 ,  過成長 ,  蛋白質-蛋白質相互作用ネットワーク ,  モジュール

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  骨格系  (EJ10030R)

引用文献 (51件)：

• J Pediatr Orthop; Epidemiology and mechanisms of femur fractures in children; RT Loder, PW O’Donnell, JR Feinberg; 26; 2006; 561-6; 10.1097/01.bpo.0000230335.19029.ab; CR1;
• J Orthop Surg Res; Residual angulation of distal tibial diaphyseal fractures in children younger than ten years; ST Jung, H Park, JH Lee, JR Kim; 9; 2014; 84; 10.1186/s13018-014-0084-5; CR2;
• Clin Orthop Relat Res; Evidence for overgrowth after midfemoral fracture via increased RNA for mitosis; N Ashraf, MH Meyer, S Frick, RA Meyer; 454; 2007; 214-22; 10.1097/01.blo.0000238783.21478.5d; CR3;
• Acta Orthop Scand; Fractures of the femoral shaft in children. The overgrowth phenomenon; F Shapiro; 52; 1981; 649-55; 10.3109/17453678108992162; CR4;
• Injury; Femoral shaft fractures in children: a prospective study of the overgrowth phenomenon; K Hougaard; 20; 1989; 170-2; 10.1016/0020-1383(89)90092-2; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： ラット ,  モデル ,  中軸 ,  大腿骨骨折 ,  骨 ,  増殖 ,  遺伝子 ,  スクリーニング