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J-GLOBAL ID：201802290882395076   整理番号：18A0790452

東アフリカのShorthorn Zebuにおける環境適応とZebu×タウリン雑種適合性のための選択の特徴【JST・京大機械翻訳】

Signatures of Selection for Environmental Adaptation and Zebu × Taurine Hybrid Fitness in East African Shorthorn Zebu

著者 (17件)： Bahbahani Hussain (Department of Biological Sciences, Faculty of Science, Kuwait University) ,  Tijjani Abdulfatai (School of Life Sciences, University of Nottingham) ,  Tijjani Abdulfatai (Centre for Genomics Research and Innovation, National Biotechnology Development Agency) ,  Mukasa Christopher (National Animal Genetic Resource Centre and Data Bank) ,  Wragg David (Centre for Tropical Livestock Genetics and Health, Roslin Institute) ,  Almathen Faisal (Department of Veterinary Public Health and Animal Husbandry, College of Veterinary Medicine, King Faisal University) ,  Nash Oyekanmi (Centre for Genomics Research and Innovation, National Biotechnology Development Agency) ,  Akpa Gerald N. (Department of Animal Science, Ahmadu Bello University) ,  Mbole-Kariuki Mary (School of Life Sciences, University of Nottingham) ,  Malla Sunir (Deep Seq Department, University of Nottingham) ,  Woolhouse Mark (Ashworth Laboratories, Centre for Immunity, Infection and Evolution, University of Edinburgh) ,  Sonstegard Tad (Recombinetics, Inc.) ,  Van Tassell Curtis (Animal Genomics and Improvement Laboratory, United States Department of Agriculture, Agricultural Research Service) ,  Blythe Martin (Deep Seq Department, University of Nottingham) ,  Huson Heather (Animal Genomics and Improvement Laboratory, United States Department of Agriculture, Agricultural Research Service) ,  Hanotte Olivier (School of Life Sciences, University of Nottingham) ,  Hanotte Olivier (International Livestock Research Institute (ILRI))
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 8  ページ： 68  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 東アフリカShorthorn Zebu(EASZ)ウシは,アフリカ環境への適応性のために,地方の農民によって好まれるアジアのzebu ×アフリカのタウリン牛の間の古代の雑種である。これらの適応性の遺伝的制御はまだ明確には理解されていない。ここでは,770,000SNPs以上のKenya(KEASZ)から92のEASZ試料を遺伝子型化し,10KEASZのプールのゲノムを配列決定した。著者らは,個体群において偶数の混合常染色体zebu ×タウリンゲノム構造を観察した。ゲノム全体のSNP分析(メタSS,Rsb,IHSおよびΔAF)およびプールされたヘテロ接合性(Hp)完全ゲノム配列分析に基づく陽性選択の合計101および165の候補領域が同定され,そのうち35領域がそれらの間に共有されている。全部で142の機能的変異体,1つの新規,がこれらの領域内で検出され,その中で,それぞれ30と26がzebuとアフリカのタウリン起源として分類された。Ugandaとナイジェリアからのzebu ×タウリン混合ウシ集団の高密度全ゲノムSNP分析は,これらの領域の25がKEASZとUgandaウシの間に共有され,7つの地域がKEASZ,Uganda,およびナイジェリアのウシを横切って共有されることを示す。共通の候補領域の同定は,18の領域を微細にマップすることを可能にする。これらの領域は生殖及び環境ストレス(例えば免疫及び熱ストレス)と関連した遺伝子及びQTLと交差し,zebu ×タウリン混合ウシのゲノムは生殖及び生存性の両方において雑種適応性を最大化するためにユニークに選択されていることを示唆した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 個体群 ,  アジア ,  常染色体 ,  ゲノム ,  ナイジェリア連邦共和国 ,  *適応性 ,  *環境順応 ,  農民 ,  遺伝的調節 ,  暑熱ストレス ,  遺伝子型 ,  *アフリカ ,  脂肪族アミン ,  スルホン酸 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 環境ストレス ,  ヘテロ接合性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： アフリカのウシ ,  正の選択 ,  環境適応 ,  ハイブリッド適合性 ,  選択信号のメタ分析

分類 (3件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  作物の品種改良  (FC02030G)

物質索引 (1件)： タウリン

タイトルに関連する用語 (5件)： アフリカ ,  環境適応 ,  タウリン ,  雑種 ,  適合性