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J-GLOBAL ID：201802290960736059   整理番号：18A0393187

原核生物における実験データは普遍的に必須補因子とゲノム-スケールの代謝モデルのバイオマス定式化の統合【Powered by NICT】

Integration of Biomass Formulations of Genome-Scale Metabolic Models with Experimental Data Reveals Universally Essential Cofactors in Prokaryotes

著者 (4件)： Xavier Joana C. (CEB - Centre of Biological Engineering, University of Minho, Campus de Gualtar, 4710-057 Braga, Portugal) ,  Xavier Joana C. (Structural and Computational Biology Unit, European Molecular Biology Laboratory, Meyerhofstrasse 1, 69117 Heidelberg, Germany) ,  Patil Kiran Raosaheb (Structural and Computational Biology Unit, European Molecular Biology Laboratory, Meyerhofstrasse 1, 69117 Heidelberg, Germany) ,  Rocha Isabel (CEB - Centre of Biological Engineering, University of Minho, Campus de Gualtar, 4710-057 Braga, Portugal)
資料名： Metabolic Engineering  (Metabolic Engineering)
巻： 39  ページ： 200-208  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1646A  ISSN： 1096-7176  CODEN： MEENFM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 高分子ビルディングブロックと他の有機分子の点で,CeO2はセルの組成は,種の代謝要求と能力の基礎となる。核酸および蛋白質のようないくつかのコアバイオマス成分は,多くの種に対し明らかであるが,特に補因子と補欠分子団,他の有機分子のプールの重要性はまだ不明である。ここでは,71種の手動で管理されたゲノムスケールモデル,33大規模遺伝子必須性データセット,酵素-補因子関連データと膨大な出版物のからのバイオマス組成を統合し,原核生物代謝のための普遍的必須補因子,また系統発生分岐または代謝モードに特異的であることを明らかにした。著者らの結果は,Klebsiella pneumoniaeにおける必須遺伝子の予測を修正とMycobacterium tuberculosisのモデルにおける失われた生合成経路を同定した。本研究では,有機補因子の必須性への基本的洞察を提供し,最小の細胞研究のためのと同様に原核生物代謝ネットワークにおけるモデリング遺伝子型-表現型関係のための意味を持っている。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *補因子 ,  *代謝 ,  表現型 ,  有機化合物 ,  タンパク質 ,  *原核生物 ,  *ゲノム ,  結核菌 ,  遺伝子型 ,  系統発生 ,  *バイオマス ,  核酸 ,  酵素 ,  モデリング
準シソーラス用語： 生合成経路 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 必須補因子 ,  代謝ネットワーク ,  ゲノムスケールモデル

分類 (1件)： 代謝と栄養  (EG03054K)

タイトルに関連する用語 (10件)： 原核生物 ,  実験データ ,  補因子 ,  ゲノム ,  スケール ,  代謝 ,  モデル ,  バイオマス ,  定式化 ,  統合