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J-GLOBAL ID：201802291938915843   整理番号：18A1653045

山東省における2012年~2016年のブタ流行性下痢ウイルス分子疫学調査とそのORF3遺伝子解析【JST・京大機械翻訳】

Epidemiological survey of porcine epidemic diarrhea virus by RT-PCR and the ORF3 gene analysis during 2012 to 2016 in Shandong

著者 (10件)： Zhang Yue (山東省動物疫病預防与控制中心,山東済南,250022) ,  Li Yujie (山東省動物疫病預防与控制中心,山東済南,250022) ,  Ma Huiling (山東省動物疫病預防与控制中心,山東済南,250022) ,  Wang Guisheng (山東省動物疫病預防与控制中心,山東済南,250022) ,  Lin Xiaoyue (山東省動物疫病預防与控制中心,山東済南,250022) ,  Sun Shengfu (山東省動物疫病預防与控制中心,山東済南,250022) ,  Kong Xianghua (山東省動物疫病預防与控制中心,山東済南,250022) ,  Wang Miaoli (山東省動物疫病預防与控制中心,山東済南,250022) ,  Chen Jing (山東省動物疫病預防与控制中心,山東済南,250022) ,  Tian Fulin (山東省動物疫病預防与控制中心,山東済南,250022)
資料名： Zhongguo Yufang Shouyixuebao  (Zhongguo Yufang Shouyixuebao)
巻： 40  号： 5  ページ： 447-450  発行年： 2018年 
JST資料番号： C3099A  ISSN： 1008-0589  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 山東省のブタ流行性下痢ウイルス(PEDV)の流行状況を把握するため、本研究では、RT-PCRの方法を用いて、2012年1月2016年12月の山東省の13の地市で採集した258の疑似PEDV感染サンプルに対して検査を行った。プライマー増幅PEDVORF3遺伝子断片を設計し、生物情報学ソフトにより26個の代表的な完全PEDVORF3遺伝子配列に対して遺伝進化分析を行った。その結果,PEDVの平均検出率は72.1%であり,PEDVが山東省の子豚の下痢の主要病原体であることを示した。遺伝的進化分析は,PEDVORF3の26株がG2遺伝子型に属し,他の参照PEDV株との相同性が高く(93.8%100%),相対的に保守的であることを示した。そのうち、3株のPEDV流行株は2a亜型に位置し、これは華北地区で初めて報告された。PEDV2a亜型の遺伝子配列は特異的部位突然変異を有し、2a亜型とその他の亜型を識別する分子マーカーとして用いることができる。本研究は山東省のPEDV流行株のORF3遺伝子の主要遺伝子型を明らかにし、この省のPEDVの予防制御に根拠を提供した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  相同性 ,  病原体 ,  感染 ,  突然変異 ,  遺伝子型 ,  *遺伝 ,  RT-PCR法
準シソーラス用語： 分子マーカー ,  サブタイプ ,  遺伝子配列 ,  バイオインフォマティクス ,  *遺伝子解析 ,  *分子疫学 ,  *山東省 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： porcine epidemic diarrhea virus ,  ORF3 gene ,  mutation ,  2a subgenotype

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： 山東省 ,  ブタ流行性下痢ウイルス ,  分子疫学 ,  調査 ,  遺伝子解析