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J-GLOBAL ID：201802292081469288   整理番号：18A1486514

PT5282-CTXM,P13190-KPC及びP30860-NRの配列決定及びIncX8プラスミドの比較ゲノミクス解析【JST・京大機械翻訳】

Sequencing of pT5282-CTXM, p13190-KPC and p30860-NR, and comparative genomics analysis of IncX8 plasmids

著者 (14件)： Fang Haihong (Beijing Academy, Beijing 100028, China) ,  Fang Haihong (State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China) ,  Feng Jiao (State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China) ,  Xu Yuanhong (The First Affiliated Hospital, Anhui Medical University, Hefei 230032, China) ,  Zhang Ying (Chinese People’s Liberation Army General Hospital, Beijing 100085, China) ,  Zhan Zhe (State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China) ,  Yin Zhe (State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China) ,  Duan Xiongbo (Department of Laboratory Medicine, The Fifth Hospital of Shijiazhuang, Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050021, China) ,  Gao Bo (State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China) ,  Tong Yigang (State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China) ,  Wang Jinglin (State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China) ,  Luo Yanping (Chinese People’s Liberation Army General Hospital, Beijing 100085, China) ,  Dai Erhei (Department of Laboratory Medicine, The Fifth Hospital of Shijiazhuang, Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050021, China) ,  Zhou Dongsheng (State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity, Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, Beijing 100071, China)
資料名： International Journal of Antimicrobial Agents  (International Journal of Antimicrobial Agents)
巻： 52  号： 2  ページ： 210-217  発行年： 2018年 
JST資料番号： W0278A  ISSN： 0924-8579  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,IncX1α,IncX1βおよびIncX2-8を含む9つの別々にクラスター化するサブグループにIncXプラスミドを分類するためのレプリコンに基づくスキームを提案した。3つのIncX8プラスミドの完全ヌクレオチド配列,すなわち,Enterobacter cloacaeからのpT5282-CTXMおよびp30860-NR,Klebsiella pneumoniaeからのp13190-KPCを測定し,2つの他の以前に配列決定したIncX8プラスミド(pCAV1003-58およびpCAV1741-16)と比較した。これらの5つのプラスミドは,遺伝子含有量と組織化に関して限られた遺伝的変異を持つ保存されたIncX8骨格を有し,それらの各々は抵抗マーカーと代謝遺伝子クラスタを持つ,トランスポゾン,挿入配列(IS)に基づく転位ユニットとミニチュア反転反復転移因子(MITE)を保有し,比較的小さいIncX8骨格が種々の外来遺伝的含量を統合できることを示した。抵抗性遺伝子bla_CTX-M-3およびbla_TEM-1(β-ラクタム耐性),bla_KPC-2(カルバペネム耐性)およびΔbla_TEM-1,およびtet(A)(テトラサイクリン耐性)およびmet(E)(マクロライド耐性)は,それぞれ,pT5282-CTXM,p13190-KPCおよびpCAV1741-16で見られた。一方,p30860-NRおよびpCAV1003-58は耐性遺伝子を持たなかった。ここで示したデータは,IncX8プラスミドの多様化と進化の歴史への洞察を提供する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝 ,  ヌクレオチド配列 ,  トランスポゾン ,  代謝 ,  クラスタ化 ,  Enterobacter ,  Klebsiella ,  薬物耐性 ,  Enterobacter cloacae ,  *プラスミド ,  多様化 ,  レプリコン ,  遺伝子
準シソーラス用語： 耐性遺伝子 ,  遺伝子クラスタ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： プラスミド ,  INCX8 ,  薬剤耐性 ,  Enterobacter cloacae ,  Klebsiella pneumoniae

分類 (3件)： 抗生物質の薬理一般  (GX05010R) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生化学  (EG03020N)

タイトルに関連する用語 (3件)： プラスミド ,  比較ゲノミクス ,  解析