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J-GLOBAL ID：201802292151692117   整理番号：18A1084798

金魚コドン用法の特徴分析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of Codon Usage Bias in Carassius auratus

著者 (8件)： Zhang Xin (北京市水産科学研究所,北京,100068) ,  You Hongzheng (天津市水産研究所,天津,300221) ,  Li Rongni (北京市水産科学研究所,北京,100068) ,  Zhu Lifei (北京市水産科学研究所,北京,100068) ,  Li Wentong (北京市水産科学研究所,北京,100068) ,  Liang Yongjun (北京市水産科学研究所,北京,100068) ,  Shi Dongjie (北京市水産科学研究所,北京,100068) ,  Sun Yansheng (北京市水産科学研究所,北京,100068)
資料名： Huabei Nongxuebao  (Huabei Nongxuebao)
巻： 32  号： z1  ページ： 30-36  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2462A  ISSN： 1000-7091  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 異なる種間の同義コドンの使用バイアスの相違が存在し、コドンの選好性の研究を展開し、遺伝子発現の特徴を深く理解し、分子育種に根拠を提供した。IlluminaHiSeq2000のハイスループットシークエンシング技術を用いて、金魚のトランスクリプトームデータを獲得した。CodingDNAsequence(CDS)は,条件付コード遺伝子配列(CDS)を選別した。CodonWソフトウェアとCUSPプログラムを用いて,蛋白質コード遺伝子の配列を分析し,コドン使用頻度を得た。結果は,8143の遺伝子が64のコドンの中の28のコドン,有効コドン数54.9,および3つの位置の平均GC含有量0.509であることを示した。金魚コドンの選好性とパターン生物は異なる程度の相違があり、酵母コドン使用頻度との差異が最も大きく、ゼブラフィッシュのコドン選好性と一致する。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酵母 ,  嗜好性 ,  遺伝子発現 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  バイアス ,  ゼブラフィッシュ ,  *コドン ,  キンギョ ,  ソフトウェア
準シソーラス用語： 使用頻度 ,  遺伝子配列 ,  分子育種 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Carassius auratus ,  Codon ,  Codon usage bias ,  GC content

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 金魚 ,  コドン ,  用法 ,  特徴分析