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J-GLOBAL ID：201802293551618896   整理番号：18A1114726

ヒツジの育種プログラムにおけるゲノム選択のための超低密度SNPパネルの使用【JST・京大機械翻訳】

Using a very low-density SNP panel for genomic selection in a breeding program for sheep

著者 (4件)： Raoul Jerome (Institut de l’Elevage, Castanet-Tolosan, France) ,  Raoul Jerome (GenPhySE, INRA, Castanet-Tolosan, France) ,  Swan Andrew A. (Animal Genetics and Breeding Unit, University of New England, Armidale, Australia) ,  Elsen Jean-Michel (GenPhySE, INRA, Castanet-Tolosan, France)
資料名： Genetics Selection Evolution (Web)  (Genetics Selection Evolution (Web))
巻： 49  号： 1  ページ： 76  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7383A  ISSN： 1297-9686  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:ゲノム選択のための効率的な参照集団は,記録された集団が小さく表現型が不十分な場合に問題であり,しばしばヒツジ育種プログラムにおける場合である。確率論的シミュレーションを用いて,非常に低密度の遺伝子型(≦1000SNP)から妨害されたダムの中密度遺伝子型[約45K単一ヌクレオチド多型(SNP)]を持つ参照集団に基づくゲノム設計を評価した。【方法】母性形質のための選択下の母集団を,実際の遺伝子型を用いてシミュレーションした。古典的選択とゲノム選択設計から実現した遺伝的利得を比較した。参照個体群構造において異なるゲノム選択シナリオ(ダムが参照に含まれるか否か)と遺伝子型の質(中密度または非常に低密度から中密度に入る)を評価した。【結果】ゲノム設計は,参照個体群が中程度の密度遺伝子型に基づいているとき,26%まで遺伝的増加を増加させた。そして,参照個体群が両方とダムの中密度遺伝子型を含んだとき,54%まで増加した。雄の候補とダムの中密度遺伝子型が非常に低密度のSNP遺伝子型(1000SNP)からの遺伝子型によって置換されたとき,利得の増加は,基準個体群で22%,siとダム参照個体群で42%であった。ゲノムシナリオにかかわらず,ゲノム設計のための近交系の増加率は,ゲノム設計に対してより低かった(-20から-34%)。【結論】著者らは,雄の候補の非常に低密度の遺伝子型と着床過程を組み合わせたダムが,小さなヒツジ育種計画のための遺伝的獲得における実質的な増加をもたらすことを示している。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 着床 ,  利得 ,  遺伝子型 ,  確率論 ,  シミュレーション ,  個体群 ,  表現型 ,  母集団 ,  一塩基多型 ,  *ゲノム ,  遺伝 ,  ダム
準シソーラス用語： 個体群構造 ,  *低密度 ,  *ゲノム選択 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 牛  (FD02020Y)

引用文献 (59件)：

• J Anim Sci; Potential benefits of genomic selection on genetic gain of small ruminant breeding programs; F Shumbusho, J Raoul, JM Astruc, I Palhière, JM Elsen; 91; 2013; 3644-3657; 10.2527/jas.2012-6205; CR1;
• van der Werf JHJ, Banks RG, Clark SA, Lee SJ, Daetwyler HD, Hayes BJ, et al. Genomic selection in sheep breeding programs. In: Proceedings of the 10th world congress on genetics applied to livestock production, 17-22 August 2014; Vancouver. 2014.http://agbu.une.edu.au/publications/10wcgalp/351_paper_10381_manuscript_1648_0.pdf. Accessed 06 April 2017.
• Livest Sci; Accuracy and expected genetic gain under genetic or genomic evaluation in sheep flocks with different amounts of pedigree, genomic and phenotypic data; J Casellas, J Piedrafita; 182; 2015; 58-63; 10.1016/j.livsci.2015.10.014; CR3;
• Genet Sel Evol; Increased genetic gains in sheep, beef and dairy breeding programs from using female reproductive technologies combined with optimal contribution selection and genomic breeding values; T Granleese, SA Clark, AA Swan, JHJ Werf; 47; 2015; 70; 10.1186/s12711-015-0151-3; CR4;
• Animal; Economic evaluation of genomic selection in small ruminants: a sheep meat breeding program; F Shumbusho, J Raoul, JM Astruc, I Palhiere, S Lemarié, A Fugeray-Scarbel; 10; 2016; 1033-1041; 10.1017/S1751731115002049; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： ヒツジ ,  育種プログラム ,  ゲノム選択 ,  低密度 ,  SNP