バーチャルクロスマッチの間のDPドナー特異抗体を決定するための電子DPepitypプロファイリングの評価【JST・京大機械翻訳】

Chen Dong-Feng; Hanshew Wendy E.; Saini Divyank; Ure Barbara; Brack Collin

文献

J-GLOBAL ID：201802295287330909 整理番号：18A1646473

バーチャルクロスマッチの間のDPドナー特異抗体を決定するための電子DPepitypプロファイリングの評価【JST・京大機械翻訳】

Evalution of electronic dp epitype profiling to determine dp donor-specific antibodies during virtual crossmatch

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資料名：
巻： 79 号： S ページ： 176 発行年： 2018年
JST資料番号： E0289B ISSN： 0198-8859 CODEN： HUIMDQ 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：短報発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

本研究の目的は,レシピエントのHLA抗体スクリーニングおよび同定アッセイによってカバーされないDP対立遺伝子を有するドナーに対するコンピュータ化仮想交差適合(VXM)ワークフローに対するepitype解析を組み込むことの有用性を評価することである。著者らの研究室では,10年以上にわたる移植のための提供されたドナーを選択するためにVXMを使用した。ドナーDP抗原がアッセイによりカバーされると,DSAはVXMにより直接測定できる。ドナー抗原がアッセイに含まれていないが,アッセイによりカバーされたDP抗原を含むエピトープ(EDP)群によりカバーされると,DSAは,手動のエピトーププロファイリングを用いたEDP抗原の陽性に基づいて決定できる。新しいepityプロファイリングシステムを,情報科学者HLAデータシステム,mTilda Lab管理システムの開発者,およびVxMatchにより展開し,HLA抗体試験でカバーされないDP対立遺伝子を電子VXMワークフローに組み込んだ。このシステムは,DPB1対立遺伝子に対する高度に多形のDP超可変領域(HVR)のデータ表を含んでいる。対立遺伝子当たりのユニークなアミノ酸プロファイルを含む6つのHVR領域(HVR-A,B,C,D,E,F)の全部があり,これまでに同じHVRモチーフに属する対立遺伝子に対応する291のエピトープグループが決定された。このシステムは受容体抗体のドナーと対立遺伝子に対するHVRモチーフを戻し,次に反応性を増加させることにより受容体抗体の対立遺伝子を分類する。全陰性および陽性HVRマッチは,構成可能な陽性カットオフ値に基づいている。ゼロの負の整合を伴う正の整合がある場合,可能なDSAの研究のために整合を色符号化した。DP抗原ビーズが陰性であれば,DP抗原により運ばれる多形性モチーフに対する抗体の存在が排除できる。コンピュータ化されたエピトーププロファイリングシステムは,分析,DPB1*16:01およびDPB1*85:01の範囲内に含まれない対立遺伝子を持つドナーに対する著者らの手動プロセスに対して検証され,HVRモチーフプロファイリングは誤差なしで実行された。DP対立遺伝子の発見の増加により,このシステムは,新しい対立遺伝子に対するHVRモチーフを決定するためにGグループを交差参照することができ,他のHLA遺伝子をプロファイルするために構成することができる。著者らの評価は,コンピュータ化されたepitypeプロファイリングを含むためにVXMを拡張することが,抗体分析によってカバーされないDP対立遺伝子を評価するための効率的で信頼できる手段であることを示唆する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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