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J-GLOBAL ID：201802298897389593   整理番号：18A0097087

’協力ブタ’TDRP遺伝子のクローニングおよび生物情報学的解析【JST・京大機械翻訳】

Cloning and bioinformatics analysis of TDRP1 gene in Hezuo pig

著者 (5件)： Jiang Yingdi (甘粛農業大学動物科学技術学院,甘粛 蘭州,730070) ,  Gun Shuangbao (甘粛農業大学動物科学技術学院,甘粛 蘭州,730070) ,  Yuan Huifang (蘭州大学第一医院,甘粛 蘭州,730000) ,  Ceng Guomin (甘粛農業大学生命科学技術学院,甘粛 蘭州,730070) ,  Gao Jingbo (甘粛農業大学生命科学技術学院,甘粛 蘭州,730070)
資料名： Gansu Nongye Daxue Xuebao  (Gansu Nongye Daxue Xuebao)
巻： 52  号： 4  ページ： 1-6  発行年： 2017年 
JST資料番号： C2901A  ISSN： 1003-4315  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】本研究の目的は,ブタにおけるTDRP1遺伝子の研究の基礎データを提供することであった。[方法]ブタのNM_001198925配列を参考にして、特異的プライマーを設計し、クローン配列決定により、「協力ブタ」TDRP1遺伝子の完全CDS配列を獲得し、生物情報学的分析を行った。同時にリアルタイム蛍光定量PCR法を用いて、異なる組織におけるTDRP1遺伝子の発現特性を測定した。[結果]TDRP1遺伝子の完全なCDS配列(GenBank登録番号:KU743254)を獲得し、合計684bpで、186個のアミノ酸ポリペプチドをコード化した。参照配列と比較して,コード化領域の33,348の部位における同義突然変異(C→G,C→T),TDRP1遺伝子の分子式はC897H1421N259O287S2,理論的等電点(PI)は5.86,不安定係数は62.66であった。疎水性指数は64.03で,平均親水性は-0.939であり,不安定な酸性蛋白質に属していた。二次構造は不規則なコイルとα-ヘリックスを主とし、混合蛋白質に属する。細胞局在化の結果は,TDRP1によってコード化された蛋白質が,遺伝子コピーと転写,翻訳において,それぞれ,26.3%と14.3%の機能を持つことを示し,それは,他の機能のそれより高い可能性があることを示した。TDRP1遺伝子は下垂体と精巣において高発現し、肺、腎臓、小脳、卵巣において中程度発現し、肝臓、脾臓、大脳、胃、小腸において低発現し、心臓組織には発現しなかった。[結論]本研究の目的は,ブタのTDRP1遺伝子の完全なCDS配列をクローン化し,2つのSNP部位を発見した。多組織転写の発現分析により、TDRP1は下垂体と睾丸において発現が高く、TDRP1遺伝子の機能を深く研究するために参考を提供できることが明らかになった。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 符号化 ,  ポリペプチド ,  心臓 ,  突然変異 ,  卵巣 ,  等電点 ,  タンパク質 ,  クローン ,  脳下垂体 ,  定量的PCR法 ,  *遺伝子 ,  脾臓 ,  アミノ酸 ,  二次構造
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (6件)： 協力 ,  ブタ ,  遺伝子 ,  クローニング ,  生物情報学 ,  解析