文献

J-GLOBAL ID：201802299242546196   整理番号：18A0288180

ex situ原子間力顕微鏡を用いた簡単なタンデム遺伝子モデルのためのオープンプロモータ複合体形成に対するヘパリンとヘパラン硫酸の影響【Powered by NICT】

Effect of heparin and heparan sulphate on open promoter complex formation for a simple tandem gene model using ex situ atomic force microscopy

著者 (5件)： Chammas Oliver (Department of Oral Biology, School of Dentistry, St James’s University Hospital, University of Leeds, Leeds LS9 7TF, UK) ,  Chammas Oliver (School of Physics and Astronomy, Woodhouse Lane, University of Leeds, LS2 9JT, UK) ,  Bonass William A. (Department of Oral Biology, School of Dentistry, St James’s University Hospital, University of Leeds, Leeds LS9 7TF, UK) ,  Thomson Neil H. (Department of Oral Biology, School of Dentistry, St James’s University Hospital, University of Leeds, Leeds LS9 7TF, UK) ,  Thomson Neil H. (School of Physics and Astronomy, Woodhouse Lane, University of Leeds, LS2 9JT, UK)
資料名： Methods  (Methods)
巻： 120  ページ： 91-102  発行年： 2017年 
JST資料番号： W0241A  ISSN： 1046-2023  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 原子間力顕微鏡(A FM)によるex situイメージングを用いた線形DNA上の大腸菌RNAポリメラーゼ(RNAP)ホロ酵素(σ~70RNAP)による開放プロモーター複合体(RP_o)形成の出現と解析に対するヘパリンとヘパラン硫酸(HepS)の影響を研究した。反応混合物へのヘパリンまたはHepSを導入A FM像で示し錯体のより良い解釈を可能にするRP_o形成,特に1つ以上のプロモータを含むDNA鋳型上での後σ~70rnapとRNAPの非特異的相互作用を有意に減少させた。以前の期待は,σRNAP結合とRP_o形成の競合的阻害剤としてしばしば用いられ,負に帯電した多糖類は,マイカ担体表面へのDNAテンプレートの結合を阻害し,それにより活性RNAP-DNA錯体のイメージング収率を低下させることである。はこの逆が真実であることを,二λ_PRプロモーターを含む簡単なタンデム遺伝子モデルのための,A FMにより検出されたRP_o生成の収率は増加することを見出した。と予想外に,HepSはヘパリンより効率的であり,試料の分散効果を有するそれらの両方で,RNAPとDNA鋳型間の望ましくないRNAP RNAP相互作用だけでなく,非特異的相互作用を最小化した。この方法の成功は,大腸菌RNAPは,すべての分子成分のマイカ表面に対して最も高い親和性を持つという観察に依存していた。著者らの系では,白雲母への三構成生体高分子の親和性はRNAP>ヘパリンまたはHepS>DNAであった。ヘパリンとHepSは雲母へのDNA結合を阻害することを示したが,大腸菌RNAPの存在はこの効果A FM分析のためのRP_osの大きな収率を克服する。この方法は他のDNA結合蛋白質と酵素に拡張したDNAより高い雲母への親和性を持つ,A FM研究のための試料調製を改善することができる。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 錯体 ,  試料調製 ,  プロモーター領域 ,  *ヘパラン硫酸 ,  生体高分子 ,  DNA【核酸】 ,  *ヘパリン ,  *複合体 ,  親和性 ,  大腸菌 ,  相互作用 ,  画像処理 ,  *原子間力顕微鏡 ,  DNA結合タンパク質
準シソーラス用語： DNA結合 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ヘパリン ,  ヘパラン硫酸 ,  大腸菌RNAポリメラーゼ ,  DNA ,  雲母 ,  A FM

分類 (1件)： 電子顕微鏡,イオン顕微鏡  (BD02050B)

タイトルに関連する用語 (7件)： 原子間力顕微鏡 ,  タンデム ,  遺伝子モデル ,  プロモータ ,  複合体 ,  ヘパリン ,  ヘパラン硫酸