特許
J-GLOBAL ID:201803001067276924
真菌由来のリボソームペプチドを製造する方法
発明者:
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出願人/特許権者:
代理人 (1件):
特許業務法人IPアシスト特許事務所
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願2017-197163
公開番号(公開出願番号):特開2018-050623
出願日: 2017年10月10日
公開日(公表日): 2018年04月05日
要約:
【課題】真菌由来のリボソームペプチドの生合成に関与する遺伝子クラスターを特定し、生産する方法の提供。【解決手段】工程a)小胞体移行シグナル配列及び反復配列を含むアミノ酸配列からなるリボソームペプチド前駆体をコードする遺伝子、特定の配列からなる塩基配列特定のアミノ酸配列に対するE値が1e-4未満でリボソームペプチドの生合成に関与するタンパク質をコードする遺伝子、若しくは1及び/又は2種の別の特定のアミノ酸配列に対するE値が1e-4未満のアミノ酸配列からなりリボソームペプチドの生合成に関与するタンパク質をコードする遺伝子を少なくとも含むリボソームペプチド生合成遺伝子クラスターを細胞内で強制発現させる工程、並びに工程b)細胞からリボソームペプチドを回収する工程を含む、製造方法。【選択図】図1
請求項(抜粋):
真菌ゲノム上のリボソームペプチド生合成遺伝子クラスター候補を推定する方法であって、
小胞体移行シグナル配列及び反復配列を含むアミノ酸配列からなるリボソームペプチド前駆体をコードする遺伝子、並びに
配列番号1に示される塩基配列に対するE値が1e-4未満でリボソームペプチドの生合成に関与するタンパク質をコードする塩基配列を有する遺伝子、
配列番号2に示されるアミノ酸配列に対するE値が1e-4未満のアミノ酸配列からなりリボソームペプチドの生合成に関与するタンパク質をコードする遺伝子若しくは
配列番号3に示されるアミノ酸配列に対するE値が1e-4未満のアミノ酸配列からなりリボソームペプチドの生合成に関与するタンパク質をコードする遺伝子、
及び/又は
配列番号6に示されるアミノ酸配列に対するE値が1e-4未満のアミノ酸配列からなりリボソームペプチドの生合成に関与するタンパク質をコードする遺伝子
を少なくとも含み、前記リボソームペプチド前駆体遺伝子とその他の前記遺伝子とが隣接している又は最大で25Kbの範囲内に位置している遺伝子クラスターをリボソームペプチド生合成遺伝子クラスター候補であると推定する工程を含む、前記推定方法。
IPC (1件):
FI (1件):
Fターム (22件):
4B050DD03
, 4B050LL05
, 4B063QA01
, 4B063QA13
, 4B063QA18
, 4B063QQ07
, 4B063QQ42
, 4B063QQ52
, 4B063QQ79
, 4B063QR32
, 4B063QR35
, 4B063QR55
, 4B063QR62
, 4B063QS25
, 4B063QX02
, 4H045AA30
, 4H045BA10
, 4H045CA15
, 4H045DA89
, 4H045EA60
, 4H045FA72
, 4H045FA74
引用特許:
出願人引用 (1件)
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麹菌遺伝子
公報種別:公開公報
出願番号:特願2002-383868
出願人:独立行政法人産業技術総合研究所, 独立行政法人製品評価技術基盤機構, 独立行政法人酒類総合研究所
審査官引用 (1件)
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麹菌遺伝子
公報種別:公開公報
出願番号:特願2002-383868
出願人:独立行政法人産業技術総合研究所, 独立行政法人製品評価技術基盤機構, 独立行政法人酒類総合研究所
引用文献:
出願人引用 (3件)
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MIDDAS-M: motif-independent de novo detection of secondary metabolite gene clusters through the inte
-
Aspergillus flavus NRRL3357 conserved hypothetical protein, mRNA
-
Aspergillus flavus NRRL3357 hypothetical protein, mRNA.
審査官引用 (3件)
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MIDDAS-M: motif-independent de novo detection of secondary metabolite gene clusters through the inte
-
Aspergillus flavus NRRL3357 conserved hypothetical protein, mRNA
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Aspergillus flavus NRRL3357 hypothetical protein, mRNA.
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