RECOG: Research Environment for Comparative Genomics

保有機関：

基礎生物学研究所

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (2件)：ゲノム/遺伝子 , 個体/種

タグ【データの種類】 (2件)：配列 , 生物分類

生物種 (10件)： Archaea (NCBI Taxonomy ID: 2157) , Bacteria (NCBI Taxonomy ID: 2) , Apicomplexa (NCBI Taxonomy ID: 5794) , Mycetozoa (NCBI Taxonomy ID: 142796) , Fungi (NCBI Taxonomy ID: 4751) , Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Drosophila (NCBI Taxonomy ID: 32281) , Bacillariophyta (NCBI Taxonomy ID: 2836) , Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702)

概要：

大規模な比較ゲノム解析を行うためのワークベンチです。クライアント・サーバ型システムで、MBGD (Microbial Genome Database for Comparative Analysis) (NBDC00130) サーバに接続してそのデータを利用することができます。多数の生物種のゲノム間でオーソログの対応付けを行い、そのオーソログテーブルを基に様々な比較解析を行うことができます。ローカル環境にダウンロードして、公開ゲノムデータに利用者のゲノムを加えた上でオーソログテーブルを作成し、比較解析を行うことも可能です。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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