資源
J-GLOBAL ID:201810009648671130   研究資源コード:NBDC02387 更新日:2018年12月04日

RECOG: Research Environment for Comparative Genomics

RECOG: Research Environment for Comparative Genomics
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): ゲノム/遺伝子 ,  個体/種
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  生物分類
生物種 (10件): Archaea (NCBI Taxonomy ID: 2157) ,  Bacteria (NCBI Taxonomy ID: 2) ,  Apicomplexa (NCBI Taxonomy ID: 5794) ,  Mycetozoa (NCBI Taxonomy ID: 142796) ,  Fungi (NCBI Taxonomy ID: 4751) ,  Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) ,  Drosophila (NCBI Taxonomy ID: 32281) ,  Bacillariophyta (NCBI Taxonomy ID: 2836) ,  Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702)
概要:
大規模な比較ゲノム解析を行うためのワークベンチです。クライアント・サーバ型システムで、MBGD (Microbial Genome Database for Comparative Analysis) (NBDC00130) サーバに接続してそのデータを利用することができます。多数の生物種のゲノム間でオーソログの対応付けを行い、そのオーソログテーブルを基に様々な比較解析を行うことができます。ローカル環境にダウンロードして、公開ゲノムデータに利用者のゲノムを加えた上でオーソログテーブルを作成し、比較解析を行うことも可能です。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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