資源
J-GLOBAL ID:201810009648671130
研究資源コード:NBDC02387
更新日:2023年09月28日
RECOG: Research Environment for Comparative Genomics
RECOG: Research Environment for Comparative Genomics
保有機関:
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (2件):
ゲノム/遺伝子
, 個体/種
タグ【データの種類】 (2件):
配列
, 生物分類
生物種 (10件):
Archaea (NCBI Taxonomy ID: 2157)
, Bacteria (NCBI Taxonomy ID: 2)
, Apicomplexa (NCBI Taxonomy ID: 5794)
, Mycetozoa (NCBI Taxonomy ID: 142796)
, Fungi (NCBI Taxonomy ID: 4751)
, Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
, Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239)
, Drosophila (NCBI Taxonomy ID: 7215)
, Bacillariophyta (NCBI Taxonomy ID: 2836)
, Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702)
概要:
大規模な比較ゲノム解析を行うためのワークベンチです。クライアント・サーバ型システムで、MBGD (Microbial Genome Database for Comparative Analysis) (NBDC00130) サーバに接続してそのデータを利用することができます。多数の生物種のゲノム間でオーソログの対応付けを行い、そのオーソログテーブルを基に様々な比較解析を行うことができます。ローカル環境にダウンロードして、公開ゲノムデータに利用者のゲノムを加えた上でオーソログテーブルを作成し、比較解析を行うことも可能です。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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