資源
J-GLOBAL ID:201810010963969579   研究資源コード:NBDC02393 更新日:2018年12月18日

ALCOdb: Algae Gene Coexpression Database

ALCOdb: Algae Gene Coexpression Database
保有機関:
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): ゲノム/遺伝子
タグ【データの種類】 (2件): 発現 ,  相互作用/パスウェイ
生物種 (2件): Chlamydomonas reinhardtii (NCBI Taxonomy ID: 3055) ,  Cyanidioschyzon merolae (NCBI Taxonomy ID: 45157)
概要:
微細藻類の遺伝子共発現データベースです。公共データベース (Sequence Read Archive: http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc01098, Gene Expression Omnibus: http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc00080) からデータを取得し、遺伝子発現マトリクスに変換して遺伝子共発現データを算出しています。遺伝子の基本情報、共発現ネットワーク、共発現する遺伝子の一覧が掲載されています。他の微細藻類やシロイヌナズナにおけるオルソログ情報からそれらの生物における共発現遺伝子を確認することもできます。遺伝子IDやキーワードによる検索や、遺伝子リストからのブラウズが可能です。また配列の相同性からの検索も可能です。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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