PED: Pancreatic Expression Database

• Barts Cancer Institute

膵臓由来の遺伝学データを収録しているデータベースです。トランスクリプトーム、プロテオーム、メチレーション、miRNAの研究から得られる遺伝子発現データベースとゲノムの研究から得られるコピー数変異データベースの2つに分かれています。文献データベースには健常者膵臓、膵臓がん、膵臓の前駆病変(PanINs)、慢性膵炎から得られた組織、細針吸引液、体液由来の幅広い検体を対象とするデータが収録されており、サンプル情報(出所、採取、前処理、性別など)や転移部位(転移性サンプル)および患者コホート情報も含まれています。細胞株やモデルマウスを使った異なる治療やプロファイルの結果も収録しています。発現量データは健常と疾患との視覚的に比較が可能です。Ensembl Genes、Variation、Regulation、InterPro、PRIDEによるアノテーションも実施されています。