資源
J-GLOBAL ID:201810020635829811   研究資源コード:NBDC02376 更新日:2019年04月25日

NGSmethDB

NGSmethDB
保有機関:
  • Computational Epigenomics Lab, Evolutionary Genomics and Bioinformatics Group, Dept. of Genetics, Inst. of Biotechnology, University of Granada
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): ゲノム/遺伝子 ,  エピジェネティクス
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  分布
生物種 (6件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) ,  Pan troglodytes (NCBI Taxonomy ID: 9598) ,  Rhesus macaque (NCBI Taxonomy ID: 9544) ,  Solanum lycopersicum (NCBI Taxonomy ID: 4081)
概要:
NGSmethDBは次世代シーケンサーから得られるホールゲノムでのメチル化データのデータベースです。主にNCBI GEOやROADMAP projectkからダウンロードされたセルラインや組織のシークエンスプロジェクトのデータを、独自に作成した解析パイプラインMethFlowで統一的に解析し、比較できるようにしています。Webサイトから全部、または領域を選んでデータがダウンロードできます。APIによってアクセスすることもできます。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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