NGSmethDB

保有機関：

Computational Epigenomics Lab, Evolutionary Genomics and Bioinformatics Group, Dept. of Genetics, Inst. of Biotechnology, University of Granada

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (2件)：ゲノム/遺伝子 , エピジェネティクス

タグ【データの種類】 (2件)：配列 , 分布

生物種 (6件)： Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) , Pan troglodytes (NCBI Taxonomy ID: 9598) , Rhesus macaque (NCBI Taxonomy ID: 9544) , Solanum lycopersicum (NCBI Taxonomy ID: 4081)

概要：

NGSmethDBは次世代シーケンサーから得られるホールゲノムでのメチル化データのデータベースです。主にNCBI GEOやROADMAP projectkからダウンロードされたセルラインや組織のシークエンスプロジェクトのデータを、独自に作成した解析パイプラインMethFlowで統一的に解析し、比較できるようにしています。Webサイトから全部、または領域を選んでデータがダウンロードできます。APIによってアクセスすることもできます。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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