研究者
J-GLOBAL ID:201901000370003390
更新日: 2025年09月29日
白石 友一
シライシ ユウイチ | Shiraishi Yuichi
所属機関・部署:
職名:
分野長
ホームページURL (1件):
http://friend1ws.github.io/
競争的資金等の研究課題 (22件):
- 2024 - 2028 がんと正常組織におけるクローン進化の解明
- 2023 - 2026 薬剤耐性と核酸医薬治療
- 2023 - 2026 肺癌における酸化ストレス応答系の新規破綻機序の解明と標的治療の探索
- 2022 - 2026 ATR依存的なDNA複製ストレス耐性による細胞生存戦略の解明
- 2022 - 2026 ATR依存的なDNA複製ストレス耐性による細胞生存戦略の解明
- 2021 - 2024 大規模トランスクリプトームからの自律的知能獲得システム基盤の開発
- 2020 - 2023 小細胞肺癌における酸化ストレス応答系の破綻機序の解明
- 2019 - 2022 横断的オミクス解析と全ゲノムシークエンスを駆使した疾患病態と組織特異性の解明
- 2018 - 2021 CRISPRライブラリースクリーニングによるリンパ腫発症の遺伝子基盤の統合的理解
- 2018 - 2021 転写異常に繋がるゲノム変異の網羅的探索法の開発とゲノム医療への応用
- 2016 - 2021 先進的シークエンス情報解析技術基盤の開発
- 2018 - 2020 新規検出アルゴリズムとロングリードシーケンスを併用した非古典的構造異常の全がん解析
- 2017 - 2020 PD-L1分子異常による、がん-免疫ネットワーク変容・破綻の分子基盤および臨床的特性の解明
- 2015 - 2020 スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索
- 2016 - 2019 がん領域における臨床ゲノム情報データストレージの整備に関する研究
- 2016 - 2018 低pH腫瘍微小環境による悪性化機構の解明
- 2016 - 2018 骨髄異形成症候群造血幹細胞移植症例におけるゲノム解析に基づいた革新的予後予測モデルの構築
- 2015 - 2018 大規模がんゲノム変異データマイニングのための統計的手法の開発
- 2013 - 2015 シークエンス解析による新規の肝炎・肝癌関連微生物の探索
- 2010 - 2015 計算とシミュレーションによるがんシステム学の創成
- 2012 - 2014 癌の病態、発病機序をゲノムレベルで理解するための統計学的手法の開発
- 2009 - 2011 統計学及びゲーム理論に基づくモデルの組合せ法の研究
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論文 (260件):
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Raúl N Mateos, Wira Winardi, Kenichi Chiba, Ai Okada, Ayako Suzuki, Yoichiro Mitsuishi, Yuichi Shiraishi. Splicing junction-based classifier for the detection of abnormal constitutive activation of the KEAP1-NRF2 system. NPJ systems biology and applications. 2024. 10. 1. 147-147
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Junji Koya, Tomohiko Tanigawa, Kota Mizuno, Haryoon Kim, Yuta Ito, Mitsuhiro Yuasa, Kentaro Yamaguchi, Yasunori Kogure, Yuki Saito, Sumito Shingaki, et al. Modeling NK-cell lymphoma in mice reveals its cell-of-origin and microenvironmental changes and identifies therapeutic targets. Nature communications. 2024. 15. 1. 9106-9106
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Qingbo S Wang, Takanori Hasegawa, Ho Namkoong, Ryunosuke Saiki, Ryuya Edahiro, Kyuto Sonehara, Hiromu Tanaka, Shuhei Azekawa, Shotaro Chubachi, Yugo Takahashi, et al. Statistically and functionally fine-mapped blood eQTLs and pQTLs from 1,405 humans reveal distinct regulation patterns and disease relevance. Nature genetics. 2024. 56. 10. 2054-2067
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Shota Kato, Aiko Sato-Otsubo, Wataru Nakamura, Masahiro Sugawa, Ai Okada, Kenichi Chiba, Nao Takasugi, Tomoya Irikura, Moe Hidaka, Masahiro Sekiguchi, et al. Genome profiling with targeted adaptive sampling long-read sequencing for pediatric leukemia. Blood Cancer Journal. 2024. 14. 1
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Shinju Iyoda, Kenichi Yoshida, Kota Shoji, Nana Ito, Miu Tanaka, Yasuhito Nannya, Genki Yamato, Shinichi Tsujimoto, Norio Shiba, Yasuhide Hayashi, et al. KRAS G12 mutations as adverse prognostic factors in KMT2A-rearranged acute myeloid leukemia. Leukemia. 2024. 38. 7. 1609-1612
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MISC (233件):
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Yuta Ito, Yasunori Kogure, Junji Koya, Kenichi Chiba, Ai Okada, Yuichi Shiraishi, Sachiko Tsukita, Koji Izutsu, Seiji Sakata, Akito Dobashi, et al. Landscape of somatic alterations in host and viral genomes in extranodal NK/T-cell lymphoma. CANCER SCIENCE. 2024. 115. 388-388
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佐伯 龍之介, 枝廣 龍哉, 曽根原 究人, 王 青波, 南宮 湖, 田中 拓, 阿瀬川 周平, 中鉢 正太郎, 難波 真一, 山本 賢一, et al. クローン性造血と新型コロナ感染症重症化リスクの関連性. 日本血液学会学術集会. 2023. 85回. 51-51
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伊藤勇太, 伊藤勇太, 木暮泰寛, 古屋淳史, 千葉健一, 岡田愛, 白石友一, 月田早智子, 伊豆津宏二, 伊豆津宏二, et al. 節外性NK/T細胞リンパ腫における宿主およびウイルスゲノムにおける体細胞異常の全体像. 日本癌学会学術総会抄録集(Web). 2023. 82nd
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Tomonori Hirano, Nobuyuki Kakiuchi, Yasuhide Takeuchi, Toshihiko Masui, Shinji Uemoto, Sachiko Minamiguchi, Hironori Haga, Yuichi Shiraishi, Satoru Miyano, Norimitsu Uza, et al. Genetic analysis of metachronous pancreatic cancers. CANCER SCIENCE. 2021. 112. 658-658
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Yotaro Ochi, Kenichi Yoshida, Ko Sasaki, Noriko Hosoya, Yusuke Shiozawa, Yasuhito Nannya, Takayuki Ishikawa, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Hiroko Tanaka, et al. Genetic profiling and prognosis of blast crisis in chronic myeloid leukemia. CANCER SCIENCE. 2021. 112. 454-454
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書籍 (15件):
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「がん全エキソーム・ゲノム情報解析」、がんゲノムペディア:77のキーワードで理解するゲノム医療とゲノム研究
羊土社 2024 ISBN:9784758121309
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「Open APIを活用したゲノムデータ共有基盤について」、実験医学増刊 Vol.41 No.15 マルチオミクス データ駆動時代の疾患研究 がん、老化、生活習慣病 最新のオミクス統合で挑む標的探索と病態解明
2023
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「がんゲノムデータの共有基盤」、実験医学増刊 Vol.41 No.7 ポストGWAS時代の遺伝統計学 オミクス解析と機械学習でヒト疾患を俯瞰する
2023
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「クラウドを使ったゲノム解析環境の構築」、実験医学 40巻 6号 スパコン・クラウドを生命科学に使う
羊土社 2022
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「がんゲノムにおけるスプライシング変異の検出」、医学のあゆみ 2675巻 5号
医歯薬出版 2020
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講演・口頭発表等 (65件):
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Precise characterization of the recurrent translocation der(1;7)(q10;p10) via longread sequencing and pangenomes
(日本人類遺伝学会 第69回大会 2024)
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Systematically developing a registry of splice-site creating variants utilizing massive publicly available transcriptome sequence data
(日本人類遺伝学会 第69回大会 2024)
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Autonomously constructing a registry of splice-site creating variants utilizing massive publicly available transcriptome
(第83回日本癌学会学術総会 2024)
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大規模シークエンスデータの時代を切り開く ゲノム解析基盤
(一般社団法人ゲノムテクノロジー研究会 第8回バイオインフォマティクス分科会「データサイエンス」 2024)
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ロングリード・パンゲノム参照配列を用いたセントロメア解析手法
(WYMM Tour: Tokyo | Oxford Nanopore Technologies 2024)
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学歴 (4件):
- 2005 - 2008 総合研究大学院大学 複合科学研究科 統計科学専攻
- 2003 - 2005 東京大学大学院 情報理工学系研究科 数理情報学専攻
- 2001 - 2003 東京大学 工学部 計数工学科
- 1999 - 2001 東京大学 教養学部 理科I類
学位 (1件):
経歴 (8件):
- 2020/04 - 現在 国立がん研究センター 研究所 ゲノム解析基盤開発分野 分野長
- 2018/04 - 2020/03 国立がん研究センター 研究所 細胞情報学分野 ユニット長
- 2014/04 - 2018/03 東京大学医科学研究所 ヒトゲノム解析センター 助教
- 2014/04 - 2014/11 シカゴ大学 人類遺伝学科 客員研究員
- 2012/06 - 2014/03 東京大学医科学研究所 ヒトゲノム解析センター 特任助教
- 2010/10 - 2012/05 東京大学医科学研究所 ヒトゲノム解析センター 特任研究員
- 2008/05 - 2010/09 独立行政法人 理化学研究所 特別研究員
- 2008/04 - 2008/04 統計数理研究所 数理・推論研究系 特任研究員
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