- 2023 - 2027 検出誤差に対して頑健な環境DNAメタバーコーディングの進展
- 2021 - 2024 生態系レジリエンスにもとづいた生態毒性評価
- 2021 - 2024 堆積物中における水生植物の埋土種子の種多様性評価と生育可能性を考慮した保全地選択
- 2020 - 2023 環境DNA分析による検出誤差を踏まえた種多様性評価手法の開発と検証
- 2020 - 2023 広域環境変動下での生物群集レジリエンス評価・予測に関する研究
- 2019 - 2022 人口減少時代の多様性保全計画:保全される生物と保全する人間に注目した枠組みの構築
- 2017 - 2021 湖沼の季節的食物網の定量化と安定性解析
- 2016 - 2020 遺伝構造の空間パターン再現モデルの開発
- 2015 - 2019 次世代型生態系観測技術の確立と湖沼生態系への適用
- 2014 - 2017 代謝理論にもとづいた食物網構造の定量化と野外生態系への応用
- 2011 - 2016 高次捕食者の生息適地を評価する機構論モデルの構築と将来予測への応用
- 2010 - 2012 食物網構造をベイズ推定する安定同位体混合モデルの開発と検証
- 2008 - 2009 時間・空間情報を統合した生物の絶滅リスク決定要因の解明
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