上田真保子

Ueda Mahoko Takahashi

所属機関・部署：
職名：助教

研究分野 (1件)：ゲノム生物学

研究キーワード (12件)：新規疾患関連遺伝子 , 免疫応答 , 細胞分化 , 細胞融合 , 系統特異性 , レトロウイルス , タンパク質構造 , バイオインフォマティクス , ゲノム進化 , 内在性ウイルス , ゲノム比較 , レトロトランスポゾン

競争的資金等の研究課題 (6件)：

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論文 (29件)：

Mahoko Takahashi Ueda, Jun Inamo, Fuyuki Miya, Mihoko Shimada, Kensuke Yamaguchi, Yuta Kochi. Functional and dynamic profiling of transcript isoforms reveals essential roles of alternative splicing in interferon response. Cell Genomics. 2024. 100654-100654
Jun Inamo, Akari Suzuki, Mahoko Takahashi Ueda, Kensuke Yamaguchi, Hiroshi Nishida, Katsuya Suzuki, Yuko Kaneko, Tsutomu Takeuchi, Hiroaki Hatano, Kazuyoshi Ishigaki, et al. Long-read sequencing for 29 immune cell subsets reveals disease-linked isoforms. Nature Communications. 2024. 15. 1
Akira Oka, Shinji Hadano, Mahoko Takahashi Ueda, So Nakagawa, Gen Komaki, Tetsuya Ando. Rare CRHR2 and GRM8 variants identified as candidate factors associated with eating disorders in Japanese patients by whole exome sequencing. Heliyon. 2024. 10. 8. e28643
Yoriyuki Konno, Keiya Uriu, Takayuki Chikata, Toru Takada, Jun-Ichi Kurita, Mahoko Takahashi Ueda, Saiful Islam, Benjy Jek Yang Tan, Jumpei Ito, Hirofumi Aso, et al. Two-step evolution of HIV-1 budding system leading to pandemic in the human population. Cell reports. 2024. 43. 2. 113697-113697
Mahoko Takahashi ueda. Retrotransposon-derived transcripts and their functions in immunity and disease. Genes & Genetic Systems. 2023. 98. 6. 305-319

MISC (28件)：

Jun Inamo, Akari Suzuki, Mahoko Ueda, Kensuke Yamaguchi, Hiroshi Nishida, Katsuya Suzuki, Yuko Kaneko, Tsutomu Takeuchi, Yasushi Ishihama, Kazuhiko Yamamoto, et al. Immune Isoform Atlas: Landscape of alternative splicing in human immune cells. 2022
上田真保子, 小野悠介, 隅山健太, 三橋里美, 三橋弘明, 中川草. 筋細胞の融合にかかわる内在性レトロウイルス由来の新規遺伝子. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2022. 24th
TAKADA Kosuke, TAKAHASHI UEDA Mahoko, SHICHINOHE Shintaro, WATANABE Tokiko, NAKAGAWA So. SARS-CoV-2のゲノム多様性は非構造蛋白質14におけるアミノ酸置換により加速される【JST・京大機械翻訳】. 日本RNA学会年会要旨集. 2022. 23rd
高田光輔, 上田真保子, 渡辺登喜子, 中川草. 新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)のnsp14のアミノ酸置換は,ゲノム進化速度を増大させる. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2021. 44th
上田真保子, KRYUKOV Kirill, 三橋里美, 三橋弘明, 今西規, 中川草. 哺乳類ゲノム内のタンパク質をコードする内在性レトロウイルスのゲノムワイド相関解析. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2020. 43rd

書籍 (3件)：

【どこでも誰でもより長くナノポアシークエンサーが研究の常識を変える!】リピート数が関与する疾患の診断に向けてサブテロメア領域のD4Z4マクロサテライトリピートを読む
(株)羊土社 2018
Chapter 12: Transcription Factor Genes
2018
ゲノムから見えてきたオランウータンのユニークな進化
エヌ・ティー・エス 2012

講演・口頭発表等 (48件)：

Functional and dynamic profiling of transcript isoforms reveals roles of isoform switching in interferon response
(Human Genetics Asia 2023 2023)
コロナウイルスのnsp14のアミノ酸置換は,ゲノム進化速度を増大させる
(日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web) 2023)
二重ホメオボックス蛋白質4(DUX4)遺伝子の新規遺伝子型決定法の確立【JST機械翻訳】|||
(日本人類遺伝学会大会(CD-ROM) 2023)
The basics of gene expression analysis in R
(DATA SCIENCE FOR GENOME DYNAMICS, Keio University)
Genomic diversity of SARS-CoV-2 can be accelerated by an amino acid substitution in the non-structural protein 14
(第23回日本RNA学会年大会 2022)

経歴 (1件)：

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上田 真保子