研究者
J-GLOBAL ID：201901010072437137   更新日: 2024年03月26日

土屋 貴穂

ツチヤ タカホ | Tsuchiya Takaho
所属機関・部署：
筑波大学 医学医療系

筑波大学 医学医療系 について


職名： 助教
ホームページURL (1件)： https://sites.google.com/view/ozakilab-jp/members
研究分野 (2件)： 生命、健康、医療情報学 ,  システムゲノム科学
研究キーワード (7件)： 情報生命科学 ,  システムバイオロジー ,  バイオインフォマティクス ,  スパースモデリング ,  空間トランスクリプトーム ,  エピゲノム ,  マルチオミクス
競争的資金等の研究課題 (5件)：
  • 2020 - 2023 1細胞空間トランスクリプトームによる細胞内と細胞間の統合ネットワーク推定手法開発
  • 2020 - 2022 2型糖尿病の代謝アダプテーション
  • 2019 - 2021 集団ゲノムデータに基づき変異を避けることによる遺伝子治療用gRNA設計法の確立
  • 2019 - 2020 集団ゲノムデータに基づき変異を避けることによる遺伝子治療用gRNA設計手法の確立
  • 2014 - 2017 シグナル伝達の時間パターンから解明するリガンド選択的な遺伝子発現機構
論文 (15件)：
  • Hideki Maehara, Toshiya Kokaji, Atsushi Hatano, Yutaka Suzuki, Masaki Matsumoto, Keiichi I. Nakayama, Riku Egami, Takaho Tsuchiya, Haruka Ozaki, Keigo Morita, et al. DNA hypomethylation characterizes genes encoding tissue-dominant functional proteins in liver and skeletal muscle. Scientific Reports. 2023. 13. 1
  • Saeko Tahara, Takaho Tsuchiya, Hirotaka Matsumoto, Haruka Ozaki. Transcription factor-binding k-mer analysis clarifies the cell type dependency of binding specificities and cis-regulatory SNPs in humans. BMC genomics. 2023. 24. 1. 597-597
  • Takaho Tsuchiya, Hiroki Hori, Haruka Ozaki. CCPLS reveals cell-type-specific spatial dependence of transcriptomes in single cells. Bioinformatics. 2022. 38. 21. 4868-4877
  • Toshiya Kokaji, Miki Eto, Atsushi Hatano, Katsuyuki Yugi, Keigo Morita, Satoshi Ohno, Masashi Fujii, Ken-ichi Hironaka, Yuki Ito, Riku Egami, et al. In vivo transomic analyses of glucose-responsive metabolism in skeletal muscle reveal core differences between the healthy and obese states. Scientific Reports. 2022. 12. 1
  • Teppei Nishino, Masaharu Yoshihara, Takahiro Nakayama, Takaho Tsuchiya, Saeko Tahara, Haruka Ozaki, Satoru Takahashi. Identifying potential regulators of JAGGED1 expression in portal mesenchymal cells. BMC research notes. 2022. 15. 1. 172-172
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MISC (9件)：
  • Saeko Tahara, Takaho Tsuchiya, Hirotaka Matsumoto, Haruka Ozaki. MOCCS profile analysis clarifies the cell type dependency of transcription factor-binding sequences and cis-regulatory SNPs in humans. bioRxiv. 2022
  • 土屋貴穂. ゲノム編集技術と大規模ゲノムデータに 基づく遺伝子治療. BIO Clinica. 2021. Vol.36. 5. 448-452
  • 土屋貴穂. ゲノム編集技術と大規模ゲノムデータに基づいた遺伝子治療の展望. Precision Medicine. 2021. Vol.4. 2. 167-171
  • 土屋貴穂. 遺伝子治療のためのゲノム編集技術と集団ゲノムデータ. Medical Science Digest. 2020. Vol.46. 12. 766-770
  • 土屋貴穂. 集団ゲノムデータから展望する遺伝子治療とプレシジョンメディシンの動向. Precision Medicine. 2020. Vol.3. 10. 630-634
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講演・口頭発表等 (21件)：
  • Predicting SNPs' effects on transcriptional factor binding and cell-type specificity using a crowd of ChIP-seq data
    (日本人類遺伝学会第67回大会)
  • MOCCS-DB: ヒト転写因子認識配列の多様性データベース
    (トーゴーの日シンポジウム2022)
  • MOCCS-DB: ヒト転写因子認識配列の多様性データベース
    (トーゴーの日シンポジウム)
  • MOCCSプロファイルで明らかにする、転写因子認識配列の細胞型特異性とヒト一塩基多型が転写因子結合へ与える影響
    (2022年日本バイオインフォマティクス学会年会・第11回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2022))
  • MOCCSプロファイルで明らかにする、転写因子認識配列の細胞型特異性とヒト一塩基多型が 転写因子結合へ与える影響
    (2022年日本バイオインフォマティクス学会年会・第11回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2022))
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学歴 (3件)：
  • 2014 - 2017 東京大学大学院 理学系研究科 生物科学専攻 博士課程
  • 2012 - 2014 東京大学大学院 理学系研究科 生物化学専攻 修士課程
  • 2007 - 2012 京都大学 理学部
学位 (1件)：
  • 博士(理学)
経歴 (4件)：
  • 2019/05 - 現在 筑波大学 人工知能科学センター
  • 2019/05 - 現在 筑波大学 医学医療系 生命医科学域 バイオインフォマティクス研究室 助教
  • 2017/04 - 2019/03 アステラス製薬株式会社 アソシエイト
  • 2014/04 - 2017/03 日本学術振興会 特別研究員(DC1)
受賞 (3件)：
  • 2021/09 - 第10回 生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021)Poster Award
  • 2020/09 - 第9回 生命医薬情報学連合大会(IIBMP2020)Poster Award
  • 2014/09 - 15th International Conference on Systems Biology Student Bursary Award
所属学会 (2件)：
日本バイオインフォマティクス学会 ,  定量生物学の会
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