研究者
J-GLOBAL ID：201901010986809652   更新日: 2024年04月16日

久保田 直人

クボタ ナオト | Kubota Naoto
所属機関・部署：
カリフォルニア大学リバーサイド校 医学部

カリフォルニア大学リバーサイド校 医学部 について


職名： 博士研究員
ホームページURL (1件)： https://naotokubota.github.io/
研究分野 (3件)： 分子生物学 ,  生命、健康、医療情報学 ,  システムゲノム科学
研究キーワード (8件)： スプライシング ,  多因子疾患 ,  GWAS ,  機能ゲノミクス ,  転写制御 ,  ゲノム情報科学 ,  分子生物学 ,  バイオインフォマティクス
競争的資金等の研究課題 (4件)：
  • 2022 - 2024 プロモーター選択を制御するSNPの解析と疾患研究への応用
  • 2022 - 2023 神経変性疾患におけるスプライシング因子制御異常の大規模情報解析
  • 2018 - 2020 比較ゲノムとHi-Cデータに基づくシス因子を介した転写調節とその破綻機構の解明
  • 2019 - 2019 生命科学ビッグデータ解析に基づく非コード領域が関与する疾患発症メカニズムの解明
論文 (12件)：
  • Youhei Mantani, Nanami Sakata, Naoto Kubota, Asaka Shimada, Satoki Nakanishi, Toshifumi Yokoyama, Nobuhiko Hoshi. Diurnal changes in bacterial settlement on the Peyer’s patch and surrounding mucosa in the rat ileum and its effect against the intestinal immune system. Cell and Tissue Research. 2023
  • Naoto Kubota, Mikita Suyama. Mapping of promoter usage QTL using RNA-seq data reveals their contributions to complex traits. PLOS Computational Biology. 2022. 18. 8. e1010436-e1010436
  • Norio Kobayashi, Hiroaki Okae, Hitoshi Hiura, Naoto Kubota, Eri H. Kobayashi, Shun Shibata, Akira Oike, Takeshi Hori, Chie Kikutake, Hirotaka Hamada, et al. The microRNA cluster C19MC confers differentiation potential into trophoblast lineages upon human pluripotent stem cells. Nature Communications. 2022. 13. 1. 3071-3071
  • Naoto Kubota, Mikita Suyama. Functional variants in hematopoietic transcription factor footprints and their roles in the risk of immune system diseases. bioRxiv. 2021
  • Naoto Kubota, Mikita Suyama. An integrated analysis of public genomic data unveils a possible functional mechanism of psoriasis risk via a long-range ERRFI1 enhancer. BMC medical genomics. 2020. 13. 1. 8-8
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MISC (1件)：
  • 久保田 直人. 公共データを活用したpromoter usage QTL解析. 実験医学増刊:ポストGWAS時代の遺伝統計学 オミクス解析と機械学習でヒト疾患を俯瞰する. 2023
講演・口頭発表等 (6件)：
  • 公共データの統合・再解析による乾癬関連機能多型の網羅的探索
    (第42回日本分子生物学会年会 2019)
  • 公共データの統合・再解析による乾癬関連機能多型の網羅的探索
    (第14回生命医科学研究所ネットワーク国際シンポジウム 2019)
  • ERRFI1 遺伝子のエンハンサークラスターに存在する一塩基多型と乾癬の発症リスク
    (第41回日本分子生物学会年会 2018)
  • 痙直型脳性麻痺発症に関与する DMRT3 遺伝子エンハンサーの同定
    (2017年度生命科学系合同年次大会 2017)
  • Identification of DMRT3 gene enhancer involved in the pathogenesis of spastic cerebral palsy
    (The 27th Hot Spring Harbor International Symposium 2017 2017)
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学歴 (3件)：
  • 2017 - 2020 九州大学大学院 システム生命科学府 システム生命科学専攻 生命医科学講座 情報生物学分野
  • 2015 - 2017 神戸大学大学院 農学研究科 資源生命科学専攻 応用動物学講座 動物分子形態学研究室
  • 2011 - 2015 神戸大学 農学部 資源生命科学科 応用動物学コース
学位 (2件)：
  • 修士(農学) (神戸大学)
  • 博士(理学) (九州大学)
経歴 (5件)：
  • 2022/05 - 現在 カリフォルニア大学リバーサイド校 医学部 博士研究員
  • 2020/06 - 2022/03 九州大学 生体防御医学研究所 助教
  • 2020/04 - 2020/05 九州大学 生体防御医学研究所 テクニカルスタッフ
  • 2018/04 - 2020/03 日本学術振興会 特別研究員(DC2)
  • 2019/04 - 2019/09 Barcelona Supercomputing Center Guest Researcher
受賞 (1件)：
  • 2018/08 - 九州大学 生体防御医学研究所 第21回リトリート 最優秀口演賞
所属学会 (1件)：
日本分子生物学会
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