清水将裕

Masahiro Shimizu

研究分野 (1件)：生物物理学

競争的資金等の研究課題 (4件)：

論文 (17件)：

Ken Morishima, Rintaro Inoue, Tatsuo Nakagawa, Masahiro Shimizu, Ritsuki Sakamoto, Tatsuro Oda, Koichi Mayumi, Masaaki Sugiyama. Size-exclusion chromatography-small-angle neutron scattering system optimized for an instrument with medium neutron flux. Journal of Applied Crystallography. 2025. 58. 2
Masahiro Shimizu, Hiroki Tanaka, Masahiro Nishimura, Nobuhiro Sato, Kayo Nozawa, Haruhiko Ehara, Shun-ichi Sekine, Ken Morishima, Rintaro Inoue, Yoshimasa Takizawa, et al. Asymmetric fluctuation of overlapping dinucleosome studied by cryo-electron microscopy and small-angle X-ray scattering. PNAS Nexus. 2024. 3. 484
清水将裕, 杉山正明. SAXSと粗視化分子動力学シミュレーションを駆使した生体分子の構造アンサンブル解析. 2024. 64. 4. 209-213
Masahiro Nishimura, Takeru Fujii, Hiroki Tanaka, Kazumitsu Maehara, Ken Morishima, Masahiro Shimizu, Yuki Kobayashi, Kayo Nozawa, Yoshimasa Takizawa, Masaaki Sugiyama, et al. Genome-wide mapping and cryo-EM structural analyses of the overlapping tri-nucleosome composed of hexasome-hexasome-octasome moieties. Communications Biology. 2024. 7. 1
Akihito Nishiyama, Masahiro Shimizu, Tomoyuki Narita, Noriyuki Kodera, Yuriko Ozeki, Akira Yokoyama, Kouta Mayanagi, Takehiro Yamaguchi, Mariko Hakamata, Amina Kaboso Shaban, et al. Dynamic action of an intrinsically disordered protein in DNA compaction that induces mycobacterial dormancy. Nucleic Acids Research. 2023. 1-15

MISC (2件)：

柚木康弘, 松本淳, 守島健, MARTEL Anne, PORCAR Lionel, 佐藤信浩, 與語理那, 與語理那, 與語理那, 富永大輝, et al. 溶液散乱と計算手法の統合解析によるシアノバクテリアの時計タンパク質KaiABC複合体の全体構造の解明. 時間生物学. 2022. 28. 2
西山晃史, 古寺哲幸, 清水将裕, Savitskaya Anna, Enany Shymaa, 真柳浩太, 山口雄大, 尾関百合子, 立石善隆, 松本壮吉. 低酸素環境と疾患(がん、感染症)の分子論低酸素休眠抗酸菌の主要タンパク質Mycobacterial DNA-binding protein 1(My cobacterial DNA-binding protein 1, a major protein in hypoxic dormant mycobacteria). 日本細菌学雑誌. 2021. 76. 1. 57-57

特許 (1件)：

講演・口頭発表等 (12件)：

天然変性タンパク質における“変性状態”の理解を目指した溶液散乱研究
(第61回日本生物物理学会年会 2023)
MD計算を用いたマルチドメインタンパク質ER-60のSANSプロファイルの解析
(日本中性子科学会第23回年会 2023)
計算モデリングによるタンパク質ライゲーション反応効率予測法の研究
(第23回日本蛋白質科学会年会 2023)
X線小角散乱プロファイルと粗視化分子動力学計算に基づく4ドメインタンパク質 ER-60 の構造研究
(第22回日本蛋白質科学会年会 2022)
X線小角散乱データと粗視化分子動力学計算に基づく生体分子の構造ダイナミクスの解明
(第59回日本生物物理学会年会 2021)

学歴 (2件)：

経歴 (5件)：

受賞 (3件)：

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清水 将裕