西村陽介

Nishimura Yosuke | Nishimura Yosuke

所属機関・部署：
職名：特任研究員

研究分野 (4件)：多様性生物学、分類学 , 進化生物学 , ゲノム生物学 , 環境動態解析

研究キーワード (11件)：ロドプシン , データベース , 遺伝子解析 , マルチオミクス , 分子系統解析 , 比較ゲノム , データ可視化 , バイオインフォマティクス , ウイルス , 海洋微生物 , メタゲノム

論文 (17件)：

Yosuke Nishimura, Susumu Yoshizawa. The OceanDNA MAG catalog contains over 50,000 prokaryotic genomes originated from various marine environments. bioRxiv. 2021
Masumi Hasegawa, Toshiaki Hosaka, Keiichi Kojima, Yosuke Nishimura, Yu Nakajima, Tomomi Kimura-Someya, Mikako Shirouzu, Yuki Sudo, Susumu Yoshizawa. A unique clade of light-driven proton-pumping rhodopsins evolved in the cyanobacterial lineage. Scientific reports. 2020. 10. 1. 16752-16752
長谷川万純, 保坂俊彰, 小島慧一, 西村陽介, 中島悠, 染谷友美, 白水美香子, 須藤雄気, 吉澤晋. シアノバクテリアの光合成とは異なる光利用:シアノロドプシンの発見. 日本地球化学会年会要旨集. 2020. 67. 186-186
Kento Tominaga, Daichi Morimoto, Yosuke Nishimura, Hiroyuki Ogata, Takashi Yoshida. In silico Prediction of Virus-Host Interactions for Marine Bacteroidetes With the Use of Metagenome-Assembled Genomes. Frontiers in microbiology. 2020. 11. 738-738
Yusuke Okazaki, Yosuke Nishimura, Takashi Yoshida, Hiroyuki Ogata, Shin-ichi Nakano. Genome-resolved viral and cellular metagenomes revealed potential key virus-host interactions in a deep freshwater lake. Environmental Microbiology. 2019. 21. 12. 4740-4754

MISC (9件)：

富永賢人, 晴気七菜, 藤原健太郎, 西村陽介, 西村陽介, 山本圭吾, 綿井博康, 左子芳彦, 緒方博之, 吉田天士. 大阪湾における海洋微生物・ウイルスの群集ダイナミクスと生態学的相互作用解析. 日本ゲノム微生物学会年会要旨集. 2019. 13th
富永賢人, 西村陽介, 山本圭吾, 緒方博之, 左子芳彦, 吉田天士. 大阪湾の海洋微生物・ウイルスの生態学的相互作用解析. 日本水産学会大会講演要旨集. 2019. 2019
岡崎友輔, 西村陽介, 吉田天士, 緒方博之, 中野伸一. メタゲノム解析でひも解く淡水湖のファージの多様性と生態. 日本微生物生態学会大会(Web). 2019. 33rd
緒方博之, BLANC-MATHIEU Romain, HINGAMP Pascal, 西村陽介, 李岩沢, 吉田天士. マルチオミクス解析が明らかにする海洋ウイルスの多様性と存在意義. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2017. 19th. 59 (WEB ONLY)
綿井博康, 本田貴史, 山本圭吾, 西村陽介, 五斗進, 緒方博之, 左子芳彦, 吉田天士. 完全長ゲノムに基づく海洋ウイルスの定量的動態解析とその宿主微生物の推定. 日本水産学会大会講演要旨集. 2016. 2016. 90

受賞 (1件)：

所属学会 (3件)：

日本ゲノム微生物学会 , 日本微生物生態学会 , 日本バイオインフォマティクス学会

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西村 陽介