西村陽介

Nishimura Yosuke | Nishimura Yosuke

所属機関・部署：
職名：研究員

研究分野 (4件)：多様性生物学、分類学 , 進化生物学 , ゲノム生物学 , 環境動態解析

研究キーワード (11件)：ロドプシン , データベース , 遺伝子解析 , マルチオミクス , 分子系統解析 , 比較ゲノム , データ可視化 , バイオインフォマティクス , ウイルス , 海洋微生物 , メタゲノム

競争的資金等の研究課題 (3件)：

論文 (30件)：

Justine Charon, Ingrida Olendraite, Marco Forgia, Li Chuin Chong, Luke S. Hillary, Simon Roux, Anne Kupczok, Humberto Debat, Shoichi Sakaguchi, Rachid Tahzima, et al. Consensus statement from the first RdRp Summit: advancing RNA virus discovery at scale across communities. Frontiers in Virology. 2024. 4
Yosuke Nishimura, Kohei Yamada, Yusuke Okazaki, Hiroyuki Ogata. DiGAlign: Versatile and Interactive Visualization of Sequence Alignment for Comparative Genomics. Microbes and Environments. 2024. 39. 1. ME23061
Mako Takada, Chunqi Jiang, Youta Sugai, Masumi Hasegawa-Takano, Takayoshi Fujiwara, Yuya Tsukamoto, Yu Nakajima, Yosuke Nishimura, Susumu Yoshizawa. Draft genome sequences of three rhodopsin possessing Croceitalea sp. strains, isolated from the sea surface microlayer in Japan. Microbiology resource announcements. 2024. e0003824
Syun-ichi Urayama, Akihito Fukudome, Miho Hirai, Tomoyo Okumura, Yosuke Nishimura, Yoshihiro Takaki, Norio Kurosawa, Eugene V. Koonin, Mart Krupovic, Takuro Nunoura. Double-stranded RNA sequencing reveals distinct riboviruses associated with thermoacidophilic bacteria from hot springs in Japan. Nature Microbiology. 2024. 9. 2. 514-523
Susumu Yoshizawa, Tomonori Azuma, Keiichi Kojima, Keisuke Inomura, Masumi Hasegawa, Yosuke Nishimura, Masuzu Kikuchi, Gabrielle Armin, Yuya Tsukamoto, Hideaki Miyashita, et al. Light-driven Proton Pumps as a Potential Regulator for Carbon Fixation in Marine Diatoms. Microbes and Environments. 2023. 38. 2. ME23015

MISC (8件)：

講演・口頭発表等 (37件)：

RNAウイルスのゲノム複製を担う酵素RdRpの「特異な」進化
(第18回日本ゲノム微生物学会年会 2024)
データベースのMAG、信頼できますか?
(日本微生物生態学会第36回大会 2023)
How to report the divided RdRps
(The First RdRp Summit 2023)
公共メタゲノムデータで土壌微生物ダークマターに光を当てる
(第70回日本生態学会大会 2023)
大規模データ解析で明らかにする海洋光合成細菌の生態学的分布とその進化
(第17回日本ゲノム微生物学会年会 2023)

Works (1件)：

経歴 (2件)：

受賞 (1件)：

所属学会 (3件)：

日本ゲノム微生物学会 , 日本微生物生態学会 , 日本バイオインフォマティクス学会

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西村 陽介