西村陽介

Nishimura Yosuke | Nishimura Yosuke

所属機関・部署：
職名：特任研究員

研究分野 (4件)：多様性生物学、分類学 , 進化生物学 , ゲノム生物学 , 環境動態解析

研究キーワード (11件)：ロドプシン , データベース , 遺伝子解析 , マルチオミクス , 分子系統解析 , 比較ゲノム , データ可視化 , バイオインフォマティクス , ウイルス , 海洋微生物 , メタゲノム

競争的資金等の研究課題 (3件)：

論文 (28件)：

Mako Takada, Chunqi Jiang, Youta Sugai, Masumi Hasegawa-Takano, Takayoshi Fujiwara, Yuya Tsukamoto, Yu Nakajima, Yosuke Nishimura, Susumu Yoshizawa. Draft genome sequences of three rhodopsin possessing Croceitalea sp. strains, isolated from the sea surface microlayer in Japan. Microbiology resource announcements. 2024. e0003824
Yosuke Nishimura, Kohei Yamada, Yusuke Okazaki, Hiroyuki Ogata. DiGAlign: Versatile and Interactive Visualization of Sequence Alignment for Comparative Genomics. Microbes and Environments. 2024. 39. 1. n/a-n/a
Shiozaki Takuhei, Yosuke Nishimura, Susumu Yoshizawa, Hideto Takami, Koji Hamasaki, Amane Fujiwara, Shigeto Nishino, Naomi Harada. Distribution and survival strategies of endemic and cosmopolitan diazotrophs in the Arctic Ocean. The ISME journal. 2023
Keiichi Kojima, Shiho Kawanishi, Yosuke Nishimura, Masumi Hasegawa, Shin Nakao, Yuya Nagata, Susumu Yoshizawa, Yuki Sudo. A blue-shifted anion channelrhodopsin from the Colpodellida alga Vitrella brassicaformis. Scientific Reports. 2023. 13. 1. 6974-6974
Kento Tominaga, Nana Ogawa-Haruki, Yosuke Nishimura, Hiroyasu Watai, Keigo Yamamoto, Hiroyuki Ogata, Takashi Yoshida. Prevalence of Viral Frequency-Dependent Infection in Coastal Marine Prokaryotes Revealed Using Monthly Time Series Virome Analysis. mSystems. 2023. 8. 1. e0093122

MISC (8件)：

講演・口頭発表等 (35件)：

データベースのMAG、信頼できますか?
(日本微生物生態学会第36回大会 2023)
公共メタゲノムデータで土壌微生物ダークマターに光を当てる
(第70回日本生態学会大会 2023)
大規模データ解析で明らかにする海洋光合成細菌の生態学的分布とその進化
(第17回日本ゲノム微生物学会年会 2023)
地球環境に棲まうウイルス「ダークマター」の実態を公共メタゲノム・ビッグデータ解析で明らかにする
(第45回日本分子生物学会年会 2022)
海洋光合成細菌の全球的分布とそのゲノム進化
(日本微生物生態学会第35回大会 2022)

Works (1件)：

経歴 (1件)：

受賞 (1件)：

所属学会 (3件)：

日本ゲノム微生物学会 , 日本微生物生態学会 , 日本バイオインフォマティクス学会

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西村 陽介