文献

J-GLOBAL ID：201902210853639870   整理番号：19A2145842

陸川ブタIGFBP5遺伝子クローンとその差次的発現分析【JST・京大機械翻訳】

Gene cloning and differential expression analysis of IGFBP5 gene in Luchuan pig

著者 (9件)： Jiao Di (广西大学動物科学技術学院,南寧,530004) ,  Pan Pengcheng (广西大学動物科学技術学院,南寧,530004) ,  Xie Wan (广西大学動物科学技術学院,南寧,530004) ,  Zhang Qiwei (广西大学動物科学技術学院,南寧,530004) ,  Ceng Linghu (广西大学動物科学技術学院,南寧,530004) ,  Sun Tiantian (广西大学動物科学技術学院,南寧,530004) ,  Chen Baojian (广西畜牧研究所/广西家畜遺伝改良重点実験室,南寧,530001) ,  Guan Zhihui (广西畜牧研究所/广西家畜遺伝改良重点実験室,南寧,530001) ,  Xie Bingkun (广西大学動物科学技術学院,南寧 530004;广西畜牧研究所/广西家畜遺伝改良重点実験室,南寧 530001)
資料名： Nanfang Nongye Xuebao  (Nanfang Nongye Xuebao)
巻： 50  号： 6  ページ： 1347-1355  発行年： 2019年 
JST資料番号： C2960A  ISSN： 2095-1191  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]陸川ブタのインシュリン成長因子結合蛋白質5(IGFBP5)遺伝子をクローニングし、その異なるブタ種における発現を明らかにして、今後のIGFBP5遺伝子が陸川豚の筋肉発育における作用機序の解明に理論的根拠を提供する。[方法]TRIzol法により、陸川豚背最長筋総RNAを抽出し、逆転写してcDNAを合成後、PCR増幅を行い、正確なシークエンシング結果をオンライン生物情報ソフトを用いてバイオインフォマティクス分析を行った。リアルタイム蛍光定量PCRを用いて、IGFBP5遺伝子が陸川豚とデュロック豚の背最長筋における発現差異を分析した。[結果]陸川ブタのIGFBP5遺伝子コード領域(CDS)の全長は816bpであり、271アミノ酸をコードし、NCBIですでに公表されているイノシシIGFBP5遺伝子(NM_214099.1)CDS配列と比べ、3つの塩基差がある。そのヌクレオチド相同性は99.6%であった。陸川ブタのIGFBP5アミノ酸配列は,NCBIで公表されたブタ(NM_214099.1),ウシ(NM_001105327.2),水牛(NM_001290940.1),馬(NM_001308603.2)であった。ヒト(NM_000599.3)、マカク(NM_001284032.1)、マウス(NM_010518.2)とラット(NM_012817.1)のIGFBP5アミノ酸配列の相同性はそれぞれ98.9%、98.2%、98であった。9,97.4%,96.7%,97.4%,95.2%;IGFBP5アミノ酸配列の相同性に基づいて構築された系統発生系統樹は、陸川豚とイノシシの遺伝距離が最も近いことを示した。陸川ブタのIGFBP5蛋白質の二次構造はα-ヘリックス、伸長鎖、β-回転角とランダムコイルからなり、そのうち、ランダムコイルが最も高く、65.68%であった。陸川ブタのIGFBP5タンパク質は膜貫通構造がなく、第120位のアミノ酸残基には1つのシグナルペプチド配列が存在する。蛋白質修飾構造の予測結果により、陸川豚IGFBP5タンパク質には2つのOグリコシル化部位、2つのNグリコシル化部位と複数の潜在的リン酸化部位が存在し、IB保存ドメインとThyro-globulin-1保存ドメインを含むことが分かった。ブタ背最長筋におけるIGFBP5遺伝子の相対的発現量は,陸川ブタの背最長筋におけるそれよりかなり高かった(P<0.01)。[結論]IGFBP5遺伝子の保存性は比較的強く、異なるブタ品種間の差次的発現は豚肉の肉率の差異を招く主な原因であり、陸川の豚の体重と赤身の肉率などの生長性状の遺伝マーカーとして開発、利用することができる。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 背最長筋 ,  ラット ,  予測 ,  *遺伝子 ,  品種 ,  アミノ酸配列 ,  グリコシル化 ,  cDNA ,  二次構造 ,  相同性 ,  マウス ,  ヒト ,  *河川
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  *差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (3件)： ブタ ,  差次的発現 ,  分析