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J-GLOBAL ID：201902211154803915   整理番号：19A1904124

蛋白質文脈はペプチド仲介相互作用に関与するか?【JST・京大機械翻訳】

Is protein context responsible for peptide-mediated interactions?

著者 (7件)： Zhou Peng (Center for Informational Biology, University of Electronic Science and Technology of China (UESTC), Qingshuihe Campus, No. 2006, Xiyuan Ave West Hi-Tech Zone, Chengdu 611731, China. [e-mail]) ,  Miao Qingqing ,  Yan Fugang ,  Li Zhongyan ,  Jiang Qianhu ,  Wen Li ,  Meng Yang
資料名： Molecular Omics  (Molecular Omics)
巻： 15  号： 4  ページ： 280-295  発行年： 2019年 
JST資料番号： W2331A  ISSN： 2515-4184  CODEN： MOOMAW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの細胞シグナル伝達経路は,ペプチド仲介相互作用(PMIs)として知られている他の(パートナー蛋白質)における一つの蛋白質(親蛋白質)における短いペプチドセグメントの結合により仲介される弱い,一時的で可逆的な蛋白質-蛋白質相互作用により調節される。以前の研究では,PMIが機能的に同等であるか,またはPMI系に関与する蛋白質-ペプチド相互作用(PTI)に類似しているという暗黙の仮説があったが,ペプチド結合への親の文脈寄与を無視している。ここでは,構造的,エネルギー的および動的レベルにおける仮説の合理性と適用性に関する系統的な研究を行った。それは,(i)ペプチドの柔軟性と非結合状態における不規則性を減少させるペプチドセグメントの立体配座制約を介してPMIsに影響を及ぼすことを明らかにし,(ii)パートナー蛋白質の活性ポケットに適合するペプチド立体配座選択を支援し,(iii)パートナーに対するペプチド充填堅固性を増強する。長い,非構造化および/または中間位置のペプチドセグメントは,短い,構造化および/または末端のものよりも,それらの文脈に対してより脆弱であるように思われる。その文脈は,それらのPTI対応物と比較して,PMIsの結合親和性と特異性の両方を適度にまたはかなり改善することが分かった。文脈支持により,ペプチドセグメントは全PMIシステムの約30~60%全結合エネルギーに寄与し,一方,寄与は文脈制約が放出されると~5~50%に減少した。さらに,ペプチド選択性は,自己阻害状態における完全長Srcファミリーキナーゼの結晶構造を調べることにより,それらの親文脈のストリッピングにより大きく損なわれるか,逆転することも観察した。従来の研究において主に関与する直接相互作用と脱溶媒和の代わりに,ペプチド柔軟性とエントロピーペナルティは,PMIsに対する文脈効果において重要な役割を果たすはずである。全体として,著者らは,ほとんどの場合,特に長く,高度に無秩序で,それらの親蛋白質の中間領域に位置するペプチドセグメントを有するものにおいて,文脈因子を無視しなければならないことを示唆する。Copyright 2019 Royal Society of Chemistry All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ペプチド ,  柔軟性 ,  エントロピー ,  *タンパク質 ,  ロバスト性 ,  ペナルティ ,  立体配座 ,  結合エネルギー ,  *相互作用 ,  ペプチド結合 ,  結晶構造
準シソーラス用語： 特異性 ,  結合親和性 ,  脆弱性 ,  蛋白質間相互作用 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (5件)： 蛋白質 ,  文脈 ,  ペプチド ,  仲介 ,  相互作用