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J-GLOBAL ID：201902211217600256   整理番号：19A1380012

閉込め環境におけるDNAサイズ【JST・京大機械翻訳】

DNA size in confined environments

著者 (1件)： Zoli Marco (School of Science and Technology, University of Camerino, I-62032 Camerino, Italy. [e-mail])
資料名： Physical Chemistry Chemical Physics  (Physical Chemistry Chemical Physics)
巻： 21  号： 23  ページ： 12566-12575  発行年： 2019年 
JST資料番号： A0271C  ISSN： 1463-9076  CODEN： PPCPFQ  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 密集した環境における短いDNA分子に対して,著者らは,クラウダーによって駆動される部位特異的拘束の強度を調整することによって,平均末端間距離およびねじれ立体配座のような巨視的パラメータを評価した。ds-DNAは三次元螺旋構造を説明し,基底対のレベルでゆらぎ効果を組み込んだメゾスコピックハミルトニアンによりモデル化した。計算法は,基底対ゆらぎが温度に依存する軌跡であると仮定し,その振幅は群衆分布に従って空間的に変調できる。末端間距離により測定した分子伸長は,閉じ込め強度により非単調に変化することを示した。さらに,クラウダーがDNA中間鎖をほとんど閉じ込めると,ヘリックスの過剰ねじれとその末端間距離が強い閉込め領域で成長することが分かった。その代わりに,クラウダーが主に一つの鎖末端をピン止めすると,分子が大きな閉じ込め強度を伸ばす間,螺旋はねじれない。したがって,著者らの結果は,クラウダープロファイルに著しく依存する伸張とねじれの間の特異な関係を提唱した。この方法は,分子を制約する環境を制御することにより,特定のDNA形状を設計するために適用できる。Copyright 2019 Royal Society of Chemistry All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヘリックス構造 ,  軌跡 ,  ゆらぎ ,  *DNA【核酸】 ,  立体配座 ,  ねじり変形 ,  モデリング ,  基底 ,  三次元
準シソーラス用語： 末端間距離 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 分子の立体配置・配座  (BH05022J) ,  分子衝突・相互作用一般  (BH07010E) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (4件)： 閉込め ,  環境 ,  DNA ,  サイズ