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J-GLOBAL ID：201902211715362124   整理番号：19A1969921

Sox2欠損マウスにおける中枢概日ペースメーカーの時間依存性トランスクリプトームを明らかにするRNA配列データ【JST・京大機械翻訳】

RNA-sequencing data highlighting the time-of-day-dependent transcriptome of the central circadian pacemaker in Sox2-deficient mice

著者 (8件)： Cheng Arthur H. (Department of Biology, University of Toronto Mississauga, Mississauga, ON, L5L 1C6, Canada) ,  Cheng Arthur H. (Department of Cell & Systems Biology, University of Toronto, Toronto, ON, M5S 3G5, Canada) ,  Bouchard-Cannon Pascale (Department of Biology, University of Toronto Mississauga, Mississauga, ON, L5L 1C6, Canada) ,  Bouchard-Cannon Pascale (Department of Cell & Systems Biology, University of Toronto, Toronto, ON, M5S 3G5, Canada) ,  Ness Rob W. (Department of Biology, University of Toronto Mississauga, Mississauga, ON, L5L 1C6, Canada) ,  Ness Rob W. (Department of Ecology & Evolutionary Biology, University of Toronto, ON, M5S 3B2, Canada) ,  Cheng Hai-Ying Mary (Department of Biology, University of Toronto Mississauga, Mississauga, ON, L5L 1C6, Canada) ,  Cheng Hai-Ying Mary (Department of Cell & Systems Biology, University of Toronto, Toronto, ON, M5S 3G5, Canada)
資料名： Data in Brief  (Data in Brief)
巻： 24  ページ： Null  発行年： 2019年 
JST資料番号： W3049A  ISSN： 2352-3409  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Sox2は,ニューロン集団における役割が明らかにされていない幹細胞関連多能性転写因子である。ここでは,対照(Sox2~fl/fl)およびSOX2条件付きノックアウト(Vgat-cre;Sox2~fl/fl)マウスのRNA配列に基づくトランスクリプトームプロファイルを,1回の24時間概日周期における4時点で示した。生の配列データを,受入番号E-MTAB-7496の下でEMBL-EBI(https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress)でArrayExpressデータベースに堆積した。本論文では,律動解析,微分表現分析,ネットワーク予測,およびRNA配列データセットからの潜在的標的同定の結果についても示した。これらのデータの解釈と議論は,「時計ニューロンにおけるSOX2依存性転写」と題する関連研究論文において見出すことができる。Chengら2019.Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *時間依存性 ,  *RNA【核酸】 ,  型ばらし ,  日周期 ,  予測 ,  汎用性 ,  微分 ,  ネットワーク ,  データベース ,  転写因子 ,  *トランスクリプトーム ,  幹細胞 ,  ニューロン
準シソーラス用語： *Sox2 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： トランスクリプトーム ,  概日リズム ,  SOX2 ,  視交叉上核 ,  マウス

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： Sox2 ,  欠損 ,  マウス ,  メーカー ,  時間依存性 ,  トランスクリプトーム ,  RNA