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J-GLOBAL ID：201902211838730548   整理番号：19A0494573

4つの既知のZiziphus種の完全葉緑体ゲノムの比較分析【JST・京大機械翻訳】

Comparative Analysis of the Complete Chloroplast Genome of Four Known Ziziphus Species

著者 (3件)： Huang Jian (Forest Key Laboratory of Shaanxi Province, College of Forestry, Northwest A & F University, Yangling 712100, China) ,  Chen Ruihong (Shaanxi Province Key Laboratory of Jujube, College of Life Science, Yan’an University, Yan’an 716000, China) ,  Li Xingang (Forest Key Laboratory of Shaanxi Province, College of Forestry, Northwest A & F University, Yangling 712100, China)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 12  ページ： 340  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Ziziphus Mill.(Rhamnaceae)は主に熱帯域から亜熱帯域に分布する約170種で構成されており,温帯域にはほとんど分布していない。いくつかのZiziphus果樹種は,特に農村地域に住む人々にとって重要なエネルギー,栄養素,および薬用資源である。今日まで,限られたゲノム情報はこの属に利用可能である。ここでは,4つの最も良く知られているZiziphus種,すなわち,Ziziphus jujba,Ziziphus acidojuja,Ziziphus mauritiana,Ziziphus spina-christiの完全葉緑体ゲノムをIllina paired-end配列決定法に基づいて組み立てた。4つのZiziphus種の葉緑体ゲノムは互いに非常に類似しており,他の開花植物に類似する構造的,遺伝子含有量,および秩序特性を示す。全葉緑体ゲノムは113個の予測されたユニークな遺伝子(85個の蛋白質コード遺伝子,8個のrRNA,37個のtRNA)をコードしており,そのうち17個は逆反復領域で複製されている。豊富な単一配列反復遺伝子座(217)がZ.jujbaで検出され,A/Tで構成された106SSR遺伝子座は比較ゲノム解析により4種を通して多型を示した。著者らは,Z.jujbaとZ.acidojujaの間の正の選択の下で4つの遺伝子だけを見出した。そして,78の蛋白質コード遺伝子の半分は,2つの群の間で陽性の選択を経験したのに対して,Z.mauritiana対Z.spina-christiのための2つの遺伝子を見つけた。系統発生分析により,Ziziphus(Rhamnaceae)はElaeagnaceaeに属し,Ziziphusの4つの種は2つのグループ(Z.jujbaとZ.acidojujba,Z.mauritianaとZ.spina-christi)にクラスタ化されたことを明らかにした。著者らの結果は,Ziziphusの遺伝子内分類のためのゲノム資源,および密接に関連したZiziphus種の個体群遺伝学および生物地理学を研究するための価値ある遺伝的マーカーを提供する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 栄養素 ,  tRNA ,  果樹 ,  タンパク質 ,  開花 ,  熱帯 ,  温帯 ,  集団遺伝 ,  *ゲノム ,  系統発生 ,  亜熱帯 ,  rRNA ,  クラスタ化
準シソーラス用語： 系統解析 ,  *葉緑体ゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Ziziphus ,  葉緑体ゲノム ,  系統発生解析 ,  マイクロサテライトマーカー ,  Ziziphus spina-chrii

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (36件)：

• Islam, M.B.; Simmons, M.P. A thorny dilemma: Testing alternative intrageneric classifications within Ziziphus (Rhamnaceae). Syst. Bot. 2006, 31, 826-842.
• Liu, M.J.; Zhao, Z.H. Germplasm resources and production of jujube in China. Acta Hortic. 2009, 840, 25-32.
• Shengrui, Y. Past, present, and future of jujubes-Chinese Dates in the United States. Hortscience 2013, 48, 672-680.
• Dov, P.; Albert, N.; Ali, I.; Debesaye, S.; Djibrilla, I. How domesticated Ziziphus mauritiana (Lam) spread in the Sahel region of Africa and in Ethiopia. Chron. Hort. 2016, 56, 5.
• Bal, J.S. Development and production of Indian jujube (Ber) in India. Acta Hortic. 2016, 1116, 15-22.

タイトルに関連する用語 (3件)： Ziziphus ,  葉緑体ゲノム ,  比較分析