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J-GLOBAL ID：201902212229863904   整理番号：19A0494530

交雑育種のためのBailinggu(Pleurotus tuoliensis)における新規多形EST-SSRマーカーの開発【JST・京大機械翻訳】

Development of Novel Polymorphic EST-SSR Markers in Bailinggu (Pleurotus tuoliensis) for Crossbreeding

著者 (6件)： Dai Yueting (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China) ,  Su Wenying (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China) ,  Yang Chentao (China National GeneBank, Environmental Genomics, Beijing Genomics Institute, Shenzhen 518083, China) ,  Song Bing (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China) ,  Li Yu (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China) ,  Fu Yongping (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 11  ページ： 325  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 単核生物の同定とそれらの交配型および雑種子孫の識別は,Pleurotus tuoliensis(Bailinggu)の交雑育種のための重要なステップである。しかし,従来の交雑育種法は面倒で時間がかかる。RNA-seq技術を用いて,Bailingguに対する新しい発現配列タグ単純配列反復(EST-SSR)マーカーを開発し,単核生物およびそれらの交配型,遺伝的多様性および雑種子孫を容易に迅速に同定した。新たに配列したBailingguトランスクリプトームから1110の潜在的ESTに基づくSSR遺伝子座を同定し,さらに検証のために100のEST-SSRをランダムに選択した。結果は,39,43および34の新規EST-SSRマーカーが,それらの親の二核体から単核生物を首尾よく同定し,2つの異なる交配型を区別し,F1およびF2雑種子孫を識別することを示した。さらに,18の高度に有益なEST-SSRを用いて,全部で86の対立遺伝子が37の単核生物で検出された。遺伝子座当たりの対立遺伝子の観察数は3~7の範囲であった。クラスタ分析は,これらの単核生物が比較的高レベルの遺伝的多様性を有することを明らかにした。近縁種Pleurotus eryngii var.ferulaeおよびPleurotus oの単核生物におけるEST-SSRの移動速度は,それぞれ72%および64%であった。したがって,著者らの研究は,Bailingguと近縁種の交雑育種を強化するための新しいSSRマーカーと効率的な方法を提供する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 対立遺伝子 ,  *交雑育種 ,  クラスタ分析 ,  *ヒラタケ属 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *マイクロサテライトマーカー ,  移動速度 ,  近縁種 ,  エリンギ ,  F2雑種 ,  遺伝多様性 ,  発現配列タグ ,  RNA-seq ,  交配型 ,  *EST-SSR , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Pleurotus tuoliensis ,  発現配列タグ単純配列反復 ,  モノカリオン ,  遺伝的多様性 ,  移植性

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  作物の品種  (FC02020V)

引用文献 (47件)：

• Zhao, M.R.; Zhang, J.X.; Chen, Q.; Wu, X.L.; Gao, W.; Deng, W.Q.; Huang, C.Y. The famous cultivated mushroom Bailinggu is a separate species of the Pleurotus eryngii species complex. Sci. Rep. 2016, 6, 33066.
• Kawai, G.; Babasaki, K.; Neda, H. Taxonomic position of a Chinese Pleurotus “Bai-Ling-Gu”, it belongs to Pleurotus eryngii (DC., Fr.) Quél. and evolved independently in China. Mycoscience 2008, 49, 75-87.
• Mou, C.J.; Cao, Y.Q.; Ma, J.L. A new variety of Pleurotus eryngii and its cultural characters. Acta Mycol. Sin. 1987, 6, 153-156.
• Zervakis, G.I.; Ntougias, S.; Gargano, M.L.; Besi, M.I.; Polemis, E.; Typas, M.A.; Venturella, G. A reappraisal of the Pleurotus eryngii complex-New species and taxonomic combinations based on the application of a polyphasic approach, and an identification key to Pleurotus taxa associated with Apiaceae plants. Fungal Biol. 2014, 118, 814-834.
• Fu, Y.P.; Yueting Dai, Y.T.; Yang, C.T.; Wei, P.; Song, B.; Yang, Y.; Sun, L.; Zhang, Z.W.; Li, Y. Comparative transcriptome analysis identified candidate genes related to Bailinggu mushroom formation and genetic markers for genetic analyses and breeding. Sci. Rep. 2017, 7, 9266.

タイトルに関連する用語 (6件)： 交雑育種 ,  Pleurotus ,  多形 ,  EST-SSR ,  マーカー ,  開発