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J-GLOBAL ID：201902212604122646   整理番号：19A1954863

中国のキャベツに感染するFusarium oxysporum f.sp.conglutinans株の遺伝的多様性,病原性,レースプロファイリングおよび比較ゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

Genetic Diversity, Virulence, Race Profiling, and Comparative Genomic Analysis of the Fusarium oxysporum f. sp. conglutinans Strains Infecting Cabbages in China

著者 (10件)： Liu Xing (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Xing Miaomiao (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Kong Congcong (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Fang Zhiyuan (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Yang Limei (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Zhang Yangyong (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Wang Yong (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Ling Jian (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Yang Yuhong (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China) ,  Lv Honghao (Institute of Vegetables and Flowers, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops, Ministry of Agriculture, Beijing, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 1373  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Fusarium oxysporum f. sp. conglutinans(FOC)によって引き起こされるキャベツFusarium萎凋病(CFW)は,世界中のキャベツの収量と品質に有意に影響することが知られている。CFWは,ニューヨーク,NY,米国で最初に検出され,中国における病気の最近の発生を含むほとんどすべてのキャベツ栽培地域に広がっている。しかしながら,中国で出現したFOC株が世界の他の地域の株と異なるかどうかは不明であった。2009年から2018年まで,著者らは中国のFOC分離株を収集し,それらを他の地域におけるレース1および2株と比較し,それらの特性を定義した。レーステストは,中国のFOC株のほとんどがレース1に属し,タイプ株52557よりも毒性が高いことを示した。ゲノムレベルの多様性を評価するため,レース2株58385に対する次世代配列決定とゲノム集合を行った。組み立てられたゲノムに基づいて,比較ゲノム解析によりレース1株FGL03-6と比較して豊富な単一ヌクレオチド多型と645挿入欠失(InDels)を発見し,全FOCレース1株は58385と異なるゲノム背景をもつ低い遺伝的変動性を有することを示した。さらに,内部転写スペーサー,伸長因子-1α,及び全ゲノムInDel変異研究は,最後がF.oxysporum Schlechhの進化解析と同様に系統発生における強力なツールであることを示唆した。レース,病原性,およびゲノムに基づく変異プロファイルは,FOCの多様性の知識に寄与し,ゲノム時代における病原体の特性化の研究を支持し,また,CFW耐性育種の手掛かりを提供することができた。著者らの知る限り,これはFOC株に対して行われた最初の広範な調査である。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： キャラクタリゼーション ,  *Fusarium oxysporum ,  一塩基多型 ,  育種 ,  *ゲノム ,  品質 ,  *遺伝 ,  *キャベツ ,  ニューヨーク州 ,  *病原性 ,  栽培 ,  病原体 ,  *Fusarium
準シソーラス用語： 分離株 ,  *プロファイリング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： キャベツ萎凋病 ,  Fusarium oxysporum f.sp.conglutinans ,  遺伝的多様性 ,  病原性 ,  分子特性化 ,  ゲノム比較

分類 (4件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  食品の汚染  (FJ01053P) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  微生物検査法  (EG02020G)

引用文献 (80件)：

• Agrios G. N. (2005). “"Chapter eleven-PLANT DISEASES CAUSED BY FUNGI,"” in Plant Pathology, ed. Agrios G. N. (San Diego, CA: Academic Press), 385-614. doi: 10.1016/B978-0-08-047378-9.50017-8
• Altschul S. F., Gish W., Miller W., Myers E. W., Lipman D. J. (1990). Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol. 215 403-410. doi: 10.1006/jmbi.1990.9999
• Appel D. J., Gordon T. R. (1996). Relationships among pathogenic and nonpathogenic isolates of Fusarium oxysporum based on the partial sequence of the intergenic spacer region of the ribosomal DNA. Mol. Plant Microbe Interact. 9 125-128. doi: 10.1094/MPMI-9-0125
• Baayen R. P., O’Donnell K., Bonants P. J., Cigelnik E., Kroon L. P., Roebroeck E. J., et al (2000). Gene genealogies and AFLP analyses in the Fusarium oxysporum complex identify monophyletic and nonmonophyletic formae speciales causing wilt and rot disease. Phytopathology 90 891-900. doi: 10.1094/PHYTO.2000.90.8.891
• Benson G. (1999). Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences. Nucleic Acids Res. 27 573-580. doi: 10.1093/nar/27.2.573

タイトルに関連する用語 (11件)： 中国 ,  キャベツ ,  感染 ,  Fusarium ,  株 ,  遺伝的多様性 ,  病原性 ,  レース ,  プロファイリング ,  比較ゲノム ,  解析