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J-GLOBAL ID：201902212613778163   整理番号：19A2220570

RNA-seq分析は有害な赤潮のRaphidophyte Chattonellaantiquaにおける光受容,栄養素取り込みおよび毒性に関連する遺伝子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

RNA-Seq Analysis Reveals Genes Related to Photoreception, Nutrient Uptake, and Toxicity in a Noxious Red-Tide Raphidophyte Chattonella antiqua

著者 (11件)： Shikata Tomoyuki (National Research Institute of Fisheries and Environment of Inland Sea, Fisheries Research and Education Agency, Hatsukaiti, Japan) ,  Takahashi Fumio (Department of Biotechnology, College of Life Sciences, Ritsumeikan University, Kusatsu, Japan) ,  Takahashi Fumio (Japan Science and Technology Agency, Precursory Research for Embryonic Science and Technology, Kawaguchi, Japan) ,  Nishide Hiroyo (Laboratory of Genome Informatics, National Institute for Basic Biology, National Institutes of Natural Sciences, Okazaki, Japan) ,  Shigenobu Shuji (Core Research Facilities, National Institute for Basic Biology, Okazaki, Japan) ,  Kamei Yasuhiro (Core Research Facilities, National Institute for Basic Biology, Okazaki, Japan) ,  Sakamoto Setsuko (National Research Institute of Fisheries and Environment of Inland Sea, Fisheries Research and Education Agency, Hatsukaiti, Japan) ,  Yuasa Kouki (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Graduate School of Science and Engineering, Saitama University, Sakura-ku, Japan) ,  Nishiyama Yoshitaka (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Graduate School of Science and Engineering, Saitama University, Sakura-ku, Japan) ,  Yamasaki Yasuhiro (Laboratory of Environmental Biology, Department of Applied Aquabiology, National Fisheries University, Fisheries Research and Education Agency, Yamaguchi, Japan) ,  Uchiyama Ikuo (Laboratory of Genome Informatics, National Institute for Basic Biology, National Institutes of Natural Sciences, Okazaki, Japan)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 1764  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 水産養殖業は有害赤潮から脅威を受けているが,被害は早期収穫や赤潮発生直前の魚給餌制限などの注意により軽減できる。したがって,赤潮発生を予測するための正確な技術が強く必要である。オミクス分析は,分子レベルでこれらの生物の生態生理学の理解を拡大し,それらの個体群動態を予測するための分子マーカーの同定と漁業に対する被害の発生を容易にする可能性を持っている。海洋性紅藻類,特にChattonella種の赤潮は,世界中の温帯気候を持つ地域においてしばしば養殖業を広く害する。Chattonellaの赤潮は沿岸に沿った栄養素の投入直後に発達する傾向がある。Chattonellaは弱い青色光により調節された日周垂直移動を示し,昼間に表面層で光合成し,夜間に底層に栄養分を取込んだ。Chattonella細胞により産生されるスーパーオキシドは,細菌および魚類に対する毒性の原因に対する強い候補である。ここでは,光合成,光受容,栄養素取り込み,およびスーパーオキシド産生のような有害赤潮の動力学に密接に関連する機能を持つ遺伝子を同定するために,Chattonella antiquaのmRNA-seqを行った。光合成色素生合成と栄養素取込に関連する遺伝子は,植物と藻類および他の赤潮微小藻類のモデル生物のそれらと高い類似性を持っていた。オーレオクローム(新たに5つの遺伝子),クリプトクローム/フォトリアーゼ(CRY/PHR)ファミリー(6-4PHR,植物CRY又はシクロブタンピリミジン二量体[CPD]クラスIII,CPDクラスII及びCRY-DASH),及びモデル生物における鞭毛運動及び細胞周期のような種々の生理学的過程を調節するフィトクローム(4遺伝子)などの光受容体のオーソログ遺伝子を同定した。細胞膜上にスーパーオキシドを産生するNADPHオキシダーゼの6つのオーソログ遺伝子が見出され,2つのタイプに分けられた:1つは5-6膜貫通ドメインを持ち,もう1つは11の膜貫通ドメインを持つ。本研究は,分子レベルにおける海洋性ミジンコ植物の生態生理学的特徴を分析するための道を開くべきである。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 光合成 ,  海洋 ,  *Chattonella ,  トランスクリプトーム ,  細菌 ,  *栄養素 ,  超酸化物 ,  細胞周期 ,  *赤潮 ,  *遺伝子 ,  細胞膜 ,  *毒性 ,  養殖 ,  mRNA ,  色素

著者キーワード (8件)： オーレオクロム ,  クリプトクローム ,  有害藻類 ,  NADPHオキシダーゼ ,  フィトクローム ,  色素生合成 ,  トランスクリプトーム ,  トランスポーター

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (87件)：

• Ahmad M., Cashmore A. R. (1993). HY4 gene of A. thaliana encodes a protein with characteristics of a blue-light photoreceptor. Nature 366 162-166. doi: 10.1038/366162a0
• Anderson A., Bothwell J. H., Laohavisit A., Smith A. G., Davies J. M. (2011). NOX or not? evidence for algal NADPH oxidases. Trends Plant Sci. 16 579-581. doi: 10.1016/j.tplants.2011.09.003
• Anderson D. M. (1997). Turning back the harmful red tide. Nature 388:513. doi: 10.1038/41415
• Bertrand M. (2010). Carotenoid biosynthesis in diatoms. Photosynth. Res. 106 89-102. doi: 10.1007/s11120-010-9589-x
• Bowler C., Allen A. E., Badger J. H., Grimwood J., Jabbari K., Kuo A., et al (2008). The Phaeodactylum genome reveals the evolutionary history of diatom genomes. Nature 456 239-244. doi: 10.1038/nature07410

タイトルに関連する用語 (8件)： RNA-seq ,  分析 ,  赤潮 ,  光受容 ,  栄養素 ,  取り込み ,  毒性 ,  遺伝子