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J-GLOBAL ID：201902212671646106   整理番号：19A0966201

Sorghum bicolorにおけるArabidopsisナトリウムプロトン対向輸送体(NHX)とヒトナトリウムプロトン交換体(NHE)相同体のゲノムワイド同定と分析【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification and Analysis of Arabidopsis Sodium Proton Antiporter (NHX) and Human Sodium Proton Exchanger (NHE) Homologs in Sorghum bicolor

著者 (18件)： Kumari P. Hima (Department of Genetics, Osmania University, Hyderabad 500 007, India) ,  Kumari P. Hima (Centre for Biotechnology, Institute of Science & Technology, JNT University, Hyderabad 500 085, India) ,  Kumar S. Anil (Department of Genetics, Osmania University, Hyderabad 500 007, India) ,  Kumar S. Anil (Centre for Biotechnology, Institute of Science & Technology, JNT University, Hyderabad 500 085, India) ,  Ramesh Katam (Department of Biological Sciences, Florida A&M University, Tallahassee, FL 32307, USA) ,  Reddy Palakolanu Sudhakar (Center of Excellence in Genomics & Systems Biology, International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Patancheru, Hyderabad 502 324, India) ,  Nagaraju M. (Department of Genetics, Osmania University, Hyderabad 500 007, India) ,  Prakash A. Bhanu (Center of Excellence in Genomics & Systems Biology, International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Patancheru, Hyderabad 502 324, India) ,  Shah Trushar (IITA-Kenya c/o International Livestock Research Institute (ILRI), PO Box 30709, Nairobi 00100, Kenya) ,  Henderson Ashley (Department of Biological Sciences, Florida A&M University, Tallahassee, FL 32307, USA) ,  Henderson Ashley (Ottawa University, Ottawa, KS 66067, USA) ,  Srivastava Rakesh K. (Center of Excellence in Genomics & Systems Biology, International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Patancheru, Hyderabad 502 324, India) ,  Rajasheker G. (Department of Genetics, Osmania University, Hyderabad 500 007, India) ,  Chitikineni A. (Center of Excellence in Genomics & Systems Biology, International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Patancheru, Hyderabad 502 324, India) ,  Varshney Rajeev K. (Center of Excellence in Genomics & Systems Biology, International Crops Research Institute for the Semi-Arid Tropics (ICRISAT), Patancheru, Hyderabad 502 324, India) ,  Rathnagiri P. (Genomix CARL Pvt. Ltd. Rayalapuram Road, Pulivendula, 516 390, Kadapa, Andhra Pradesh, India) ,  Narasu M. Lakshmi (Centre for Biotechnology, Institute of Science & Technology, JNT University, Hyderabad 500 085, India) ,  Kishor P. B. Kavi (Department of Genetics, Osmania University, Hyderabad 500 007, India)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 9  号： 5  ページ： 236  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Na+輸送体は塩ストレスと発生時に重要な役割を果たす。本研究は,Sorghum bicolorにおけるナトリウム-プロトン対向輸送体(NHX)およびナトリウム-プロトン交換体(NHE)型輸送体のin silico分析,および様々な非生物的ストレス条件下でのそれらの発現パターンにおける全ゲノム同定を目的とした。Sorghumにおいて,7つのNHXと9つのNHEホモログが同定された。アミロライド(Na+/H+交換体活性の既知阻害剤)結合モチーフは両タイプの輸送体で認められた。染色体2は5つのナトリウム輸送体を有するホットスポット領域であることが分かった。系統発生分析は,6つのオーソログと3つのパラログ群を推論した。SbNHX/NHE輸送体の機能的多様性への洞察を得るために,胚,根,茎および葉組織における塩,干ばつ,熱および寒冷ストレス下でリアルタイム遺伝子発現を行った。発現パターンは,SbNHXsとSbNHEの両方が単一または複数の非生物的ストレスに応答することを明らかにした。予測された蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークは,SbNHX7のみがカルシニューリンB様蛋白質(CBL)-CBL相互作用蛋白質キナーゼ(CIPK)経路に関与することを明らかにした。本研究は,異なる非生物的ストレス条件下でのSorghumにおける組織特異的発現を伴うSbNHX/NHE輸送体遺伝子の機能的相違に関する洞察を提供する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  相互作用 ,  寒冷ストレス ,  *陽子 ,  ネットワーク ,  *Arabidopsis ,  遺伝子発現 ,  *モロコシ属 ,  *モロコシ
準シソーラス用語： オルソログ ,  阻害剤 ,  遺伝子発現パターン ,  非生物的ストレス ,  塩分ストレス ,  *輸送体 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 非生物的ストレス ,  アミロリド ,  CBL-CIPK経路 ,  ナトリウム-プロトン交換器 ,  ナトリウム-プロトン対向輸送体 ,  Sorghum bicolor

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物の生化学  (EH01050J)

引用文献 (76件)：

• Bassil, E.; Coku, A.; Blumwald, E. Cellular ion homeostasis: Emerging roles of intracellular NHX Na+/H+antiporters in plant growth and development. J. Exp. Bot. 2012, 63, 5727-5740.
• Bohnert, H.J.; Nelsen, D.E.; Jensen, R.G. Adaptation to environmental stresses. Plant Cell 1995, 7, 1099-1111.
• An, R.; Chen, Q.J.; Chai, M.F.; Lu, P.L.; Su, Z.; Qin, Z.X.; Chen, J.; Wang, X.C. AtNHX8, a member of the monovalent cation: Proton antiporter-1 family in Arabidopsis thaliana, encodes a putative Li+/H+ antiporter. Plant J. 2007, 49, 718-728.
• Mojca, B.; Tanja, B.; Ljerka, L.; Nada, K. A comparative genomic analysis of calcium and proton signaling/homeostasis in Aspergillus species. Fungal Genet. Biol. 2009, 46, S93-S104.
• Amtmann, A.; Sanders, D. Mechanisms of Na+ uptake by plant cells. Adv. Bot. Res. 1999, 29, 76-112.

タイトルに関連する用語 (10件)： Sorghum ,  Arabidopsis ,  ナトリウム ,  プロトン ,  対向輸送体 ,  NHE ,  相同体 ,  ゲノム ,  同定 ,  分析