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J-GLOBAL ID：201902212698690197   整理番号：19A2051147

ハイスループットシークエンシング技術に基づく普通のワタモモセットの糞便微生物多様性の測定【JST・京大機械翻訳】

Analysis of microbial diversity in feces of the common cotton-eared marmosets by high-throughput sequencing

著者 (8件)： Zhang Feiyan (中国科学院昆明動物研究所,昆明,650000) ,  Jin Jie (中国科学院昆明動物研究所,昆明,650000) ,  Liu Chao (中国科学院昆明動物研究所,昆明,650000) ,  Wang Yun (中国科学院昆明動物研究所,昆明,650000) ,  Xie Lifen (中国科学院昆明動物研究所,昆明,650000) ,  Zhang Xiaodi (中国科学院昆明動物研究所,昆明,650000) ,  Wu Jiwen (中国科学院昆明動物研究所,昆明,650000) ,  Lv Longbao (中国科学院昆明動物研究所,昆明 650000;中国科学院昆明霊長類研究中心,昆明 650223)
資料名： Zhongguo Shiyan Dongwu Xuebao  (Zhongguo Shiyan Dongwu Xuebao)
巻： 27  号： 3  ページ： 366-373  発行年： 2019年 
JST資料番号： C3084A  ISSN： 1005-4847  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的:ハイスループットシークエンシング技術を用い、普通の綿耳マーモセットの糞便フローラの構造と組成を分析し、新型の実験動物の更なる開発と利用に基礎を築く。方法:4匹の雄の普通のコットルマーモセットの糞便を採集し、細菌の16SrRNAの汎用プライマーでV3V4区を増幅し、IlluminaMiSeqのシークエンシングプラットフォームを用いて普通の綿耳マーモセットの糞便微生物に対して研究を行った。【結果】合計315511の有効な配列と596のOTUを得た。9つの門,14の綱,26の目,50の科,82の属と64の種と226のOTUが,普通のワタのモモセットの糞便の細菌で同定された,そして,それは,9つの門,14の綱,26の目,50の科,82の属,64の種と226のOTUであった。その中、優勢門はバクテロイデス門(Bacteroidetes)と厚壁菌門(Firmicutes)であり、平均含有量はそれぞれ54.52%と25であった。39%2の最も高い豊度は,BacteroidiaとNegativicutesであり,平均含有量は54.5%と17%であった。3)乳酸桿菌目(Lactobacillales)とBacteroidales(Bacteroidales)の豊度は,それぞれ50.01%と20.52%であった。PrevotellaceaeとBifidobacteriaceaeの豊度は,それぞれ43.14%と11.33%であった。5)ビフィズス菌属(Bifidobacterium)とバクテロイデス属(Bacteroides)の豊度は高く、平均含有量は11.33%11.12%であった。6)有益な細菌叢のビフィズス菌属の豊度は高いが、検出されたサンプルに含まれている。7)豊度が最も高い前10種,7科,5綱に分類された。この10種は33.16%を占め、他の53種の総和は0.74%を占め、他の未同定菌種、しかも相対存在度も高く、さらに研究する必要がある。8)PICRUSt機能予測分析:アミノ酸輸送などの代謝機能とタンパク質翻訳、折り畳み遺伝情報処理機能存在度が高い。結論:ハイスループットシークエンシング技術を用い、普通の綿耳マーモセットの糞便細菌叢を全面的に検査し、普通の綿耳マーモセットの糞便細菌組成には豊富な多様性があり、その中にまだ分類されていない、比較的存在度の高い細菌が多く、さらに研究する必要がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 代謝 ,  *マーモセット ,  大腸菌 ,  実験動物 ,  細菌 ,  ビフィズス菌 ,  Bacteroides ,  フローラ ,  予測
準シソーラス用語： 細菌叢 ,  Bacteroidales目 ,  Firmicutes ,  *配列解析 ,  16S rRNA ,  *微生物多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： ワタ ,  モモ ,  糞便 ,  微生物多様性