文献

J-GLOBAL ID：201902213207069947   整理番号：19A0659925

プローブとしての足場およびトリプトファン置換としてグラミシジンAを用いた残基-二分子層相互作用の特性化【JST・京大機械翻訳】

Characterizing Residue-Bilayer Interactions Using Gramicidin A as a Scaffold and Tryptophan Substitutions as Probes

著者 (6件)： Beaven Andrew H. (Department of Chemistry, The University of Kansas, Kansas, United States) ,  Sodt Alexander J. (Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development, National Institutes of Health) ,  Pastor Richard W. (Laboratory of Computational Biology, National Heart, Lung and Blood Institute, National Institutes of Health) ,  Koeppe Roger E. II (Department of Chemistry and Biochemistry, University of Arkansas, Arkansas, United States) ,  Andersen Olaf S. (Department of Physiology and Biophysics, Weill Cornell Medical College, New York, United States) ,  Im Wonpil (Departments of Biological Sciences and Bioengineering, Lehigh University, Pennsylvania, United States)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 13  号： 10  ページ： 5054-5064  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 以前の実験により,脂質二分子層におけるグラミシジンA二量体チャンネル(二つの非伝導性単量体から形成される)の寿命は,二層-水界面におけるトリプトファン(Trp)残基の変異により調節されることを示した。異なる尾部長を持つホスファチジルコリン二分子層のTrp位置における種々のgA二量体及び単量体変異体の広範な分子動力学シミュレーションを用いてこれをさらに調べた。周囲二分子層とのgA相互作用はこれらTrp残基の変異により強く調節された。3つの主な効果がある。すなわち,残留水素結合能(すなわち,チャネル-単層結合強度の減少)の除去は,集合二量体チャネルによって引き起こされる二層変形の程度を減少させる。残基のサイズと形状はその配向に影響し,異なる水素結合パートナーをもたらす;そして,残基の疎水性の増加は,二分子層中心に対するgA単量体挿入の深さを増加させ,それにより,脂質曲げフラストレーションを増加させた。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *プローブ ,  水素結合 ,  *相互作用 ,  界面 ,  単量体 ,  *キャラクタリゼーション ,  単一層 ,  計算機シミュレーション ,  レシチン ,  チャネル ,  疎水性 ,  ポリペプチド ,  アミノ酸 ,  窒素複素環化合物 ,  芳香族縮合化合物 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  二層 ,  *残基 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H)

物質索引 (2件)： グラミシジンA ,  トリプトファン

タイトルに関連する用語 (9件)： プローブ ,  足場 ,  トリプトファン ,  置換 ,  グラミシジンA ,  残基 ,  二分子層 ,  相互作用 ,  特性化