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J-GLOBAL ID：201902213598269297   整理番号：19A1951316

タイにおいてシクロ(テトラヒドロキシブチラート生産はXenorhabdusとPhotorhabdus分離株の識別に十分である【JST・京大機械翻訳】

Cyclo(tetrahydroxybutyrate) production is sufficient to distinguish between Xenorhabdus and Photorhabdus isolates in Thailand

著者 (13件)： Tobias Nicholas J. (Molekulare Biotechnologie, Goethe-Universitaet Frankfurt, Frankfurt am Main, Germany) ,  Tobias Nicholas J. (LOEWE Centre for Translational Biodiversity Genomics (LOEWE-TBG), 60325, Frankfurt am Main, Germany) ,  Parra-Rojas Cesar (Frankfurt Institute for Advanced Studies, Ruth-Moufang-Strasse 1, 60438, Frankfurt am Main, Germany) ,  Shi Yan-Ni (Molekulare Biotechnologie, Goethe-Universitaet Frankfurt, Frankfurt am Main, Germany) ,  Shi Yi-Ming (Molekulare Biotechnologie, Goethe-Universitaet Frankfurt, Frankfurt am Main, Germany) ,  Simonyi Svenja (Molekulare Biotechnologie, Goethe-Universitaet Frankfurt, Frankfurt am Main, Germany) ,  Thanwisai Aunchalee (Department of Microbiology and Parasitology, Faculty of Medical Science, Naresuan University, Phitsanulok, 65000, Thailand) ,  Vitta Apichat (Department of Microbiology and Parasitology, Faculty of Medical Science, Naresuan University, Phitsanulok, 65000, Thailand) ,  Chantratita Narisara (Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Tropical Medicine, Mahidol University, Bangkok, 10400, Thailand) ,  Hernandez-Vargas Esteban A. (Frankfurt Institute for Advanced Studies, Ruth-Moufang-Strasse 1, 60438, Frankfurt am Main, Germany) ,  Bode Helge B. (Molekulare Biotechnologie, Goethe-Universitaet Frankfurt, Frankfurt am Main, Germany) ,  Bode Helge B. (LOEWE Centre for Translational Biodiversity Genomics (LOEWE-TBG), 60325, Frankfurt am Main, Germany) ,  Bode Helge B. (Buchmann Institute for Molecular Life Sciences, Goethe-Universitaet Frankfurt, 60438, Frankfurt am Main, Germany)
資料名： Environmental Microbiology  (Environmental Microbiology)
巻： 21  号： 8  ページ： 2921-2932  発行年： 2019年 
JST資料番号： W2561A  ISSN： 1462-2912  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Photorhabus属とXenorabus属の細菌は,それらの類似の共生ライフサイクルを支持するために多くの天然物を生産する。これらの化合物の多くに対して,特異的生物活性は未知である。研究努力を優先することを試みたときの自然製品研究における一つの一般的な挑戦は,異なる株からの同一(または高度に類似した)化合物の再発見である。ゲノム配列を代謝産物生産に結び付けることはこの問題を克服するのに役立つ。しかし,配列は典型的に生物の全収集に利用できない。ここでは,タイ国にわたる114株収集(58のPhotorhabusと56のXenorabus)に関連するHPLC-MSデータを用いて包括的代謝スクリーニングを行い,いくつかの非生物的因子と一致する株間の代謝変動を調べた。すべての与えられたメタデータを決定する際に,個々の代謝産物の重要性をランク付けするために機械学習を利用する。このアプローチにより,天然産物研究の文脈で代謝産物を優先化することができ,未知化合物の同定につながった。上位3つの最も高いランク付け特徴は,Xenorusと関連しており,同じ化学実体,シクロ(テトラヒドロキシブチラートに起因していた。本研究はまた,ハイスループット代謝研究における優先順位付けの必要性を扱い,将来の研究におけるそのようなアプローチの実行可能性を実証する。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 代謝産物 ,  細菌 ,  ライフサイクル ,  *代謝 ,  生物活性 ,  共生 ,  機械学習 ,  等級づけ ,  メタデータ ,  スクリーニング ,  天然材料
準シソーラス用語： ハイスループット ,  ゲノム配列 ,  *Photorhabdus ,  *Xenorhabdus , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (6件)： タイ ,  シクロ ,  Xenorhabdus ,  Photorhabdus ,  分離株 ,  識別