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J-GLOBAL ID：201902214791649036   整理番号：19A2862718

バイオデポ-ワークフロー-ビルダを用いた格納されたワークフローの構築【JST・京大機械翻訳】

Building Containerized Workflows Using the BioDepot-Workflow-Builder

著者 (9件)： Hung Ling-Hong (School of Engineering and Technology, University of Washington, Tacoma, WA 98402, USA) ,  Hu Jiaming (School of Engineering and Technology, University of Washington, Tacoma, WA 98402, USA) ,  Meiss Trevor (School of Engineering and Technology, University of Washington, Tacoma, WA 98402, USA) ,  Ingersoll Alyssa (School of Engineering and Technology, University of Washington, Tacoma, WA 98402, USA) ,  Lloyd Wes (School of Engineering and Technology, University of Washington, Tacoma, WA 98402, USA) ,  Kristiyanto Daniel (School of Engineering and Technology, University of Washington, Tacoma, WA 98402, USA) ,  Xiong Yuguang (Icahn School of Medicine at Mount Sinai, 1468 Madison Ave, New York, NY 10029, USA) ,  Sobie Eric (Icahn School of Medicine at Mount Sinai, 1468 Madison Ave, New York, NY 10029, USA) ,  Yeung Ka Yee (School of Engineering and Technology, University of Washington, Tacoma, WA 98402, USA)
資料名： Cell Systems  (Cell Systems)
巻： 9  号： 5  ページ： 508-514.e3  発行年： 2019年 
JST資料番号： W3087A  ISSN： 2405-4712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 著者らは,ユーザがドラッグアンドドロップインタフェイスを用いて再現性のあるバイオインフォマティクスワークフローを作成し実行することを可能にするソフトウェアツールであるBioDepotワークフロービルダー(BWB)を提示した。グラフィカルな幅はモジュールタスクを実行するDockerコンテナを代表する。異なる局所的および雲プラットフォームにわたって再現性良く展開することができるバイオインフォマティクスワークフローを構築するために,広域的にリンクされる。各widは,中間結果を表示するためのパラメータ入力とコンソールを容易にするために,形式ベースのユーザインタフェイスを含んでいる。BWBは,広範囲,コンテナ,およびワークフローの迅速なカスタム化のためのツールを提供する。保存されたワークフローは,BWBのネイティブフォーマットを用いて共有されるか,またはシェルスクリプトとして輸出される。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 支援プログラム ,  インタフェイス ,  コンソール ,  コンテナ ,  ソフトウェア開発 ,  カスタム化 ,  *ワークフロー ,  ビルダー ,  再現性 ,  ユーザインタフェイス
準シソーラス用語： スクリプト ,  バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 研究の再現性 ,  バイオインフォマティクスワークフロー ,  ソフトウェア開発 ,  RNAシークエンシング ,  ドッカー

分類 (3件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (4件)： デポ ,  ワークフロー ,  ビルダ ,  構築