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J-GLOBAL ID:201902215210241279   整理番号:19A1406485

4N-1は2′-デオキシシチジン単独重合体のDNA i-モチーフ折畳みにおける「スイートスポット」である【JST・京大機械翻訳】

4n-1 Is a “Sweet Spot” in DNA i-Motif Folding of 2′-Deoxycytidine Homopolymers
著者 (8件):
資料名:
巻: 139  号: 13  ページ: 4682-4689  発行年: 2017年04月05日 
JST資料番号: C0254A  ISSN: 0002-7863  CODEN: JACSAT  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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2′-デオキシシチジン(dC)ヌクレオチドの4個またはそれ以上の隣接ランを有するDNAの鎖は,一般的に穏やかな酸性条件下でi-モチーフ折畳みを採用する可能性を有する。5つの異なるpH依存法により10から30ヌクレオチドまでの長さ範囲のdCホモオリゴヌクレオチド鎖の分析は,鎖長対安定性のパターンを同定した。dC_11から始まり,遷移pH(pH_T)は鎖長と共に4ヌクレオチドまで増加し,その後安定性は劇的に減少し,傾向はdC_27までこのサイクルを繰り返した。分析は,長さ15,19,23および27ヌクレオチド(すなわち,4n-1)のdC_n鎖を見出し,pH7.0でpH_T値>7.2および熱安定性>37°Cを有した。i-モチーフのループ長をロックするためのチミジンヌクレオチドを用いたモデル研究は,最も安定なdC_n i-モチーフが3つのループの各々に1つのヌクレオチドを有し,コアが偶数の塩基対を構築するという結論を支持する。モデル研究から同定されたパターンは,dC_n鎖に対して得られた結果と一致して,15,19,23および27の長さで4つのヌクレオチドの頻度で起こる。この観察により,dC_nランのヒトゲノムを調べた。ヒトゲノムの検査は,dC_nランがゲノム(プロモーター,UTR,およびイントロン)の重要な領域に濃縮されていることを示しているが,コーディングおよび遺伝子間領域では枯渇しており,これらの知見は生物学的意味を持つ可能性がある。最後に,鎖長によりiモチーフ安定性を調節する能力は,DNA足場,センサ,ナノテクノロジー,および他の化学応用における刺激応答応用に利用される可能性がある。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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核酸一般 
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