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J-GLOBAL ID：201902215837005740   整理番号：19A0208345

CrDRBs遺伝子のクローニングとバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Cloning and bioinformatics analysis of CrDRBs in Chlamydomonas reinhardtii

著者 (5件)： Lou Sulin (深zhen大学生命与海洋科学学院,深zhen市海洋生物資源与生態環境重点実験室,广東深zhen518060;深zhen大学光電工程学院,光電子器件与系統教育部/广東省重点実験室,广東深zhen518060;广東省植物表観遺伝学重点実験室,广東深zhen518060) ,  Lin Xin (深zhen大学生命与海洋科学学院,深zhen市海洋生物資源与生態環境重点実験室,广東深zhen518060;广東省植物表観遺伝学重点実験室,广東深zhen518060) ,  Huang Simin (深zhen大学生命与海洋科学学院,深zhen市海洋生物資源与生態環境重点実験室,广東深zhen518060;广東省植物表観遺伝学重点実験室,广東深zhen518060) ,  Li Hui (深zhen大学生命与海洋科学学院,深zhen市海洋生物資源与生態環境重点実験室,广東深zhen518060;广東省植物表観遺伝学重点実験室,广東深zhen518060;深zhen大学竜華生物産業創新研究院,深zhen市海洋藻類生物工程技術研究中心,广東深zhen518060) ,  Hu Zhangli (深zhen大学生命与海洋科学学院,深zhen市海洋生物資源与生態環境重点実験室,广東深zhen518060;深zhen大学光電工程学院,光電子器件与系統教育部/广東省重点実験室,广東深zhen518060;广東省植物表観遺伝学重点実験室,广東深zhen518060;深zhen大学竜華生物産業創新研究院,深zhen市海洋藻類生物工程技術研究中心,广東深zhen518060)
資料名： Shenzhen Daxue Xuebao. Ligong Ban  (Shenzhen Daxue Xuebao. Ligong Ban)
巻： 35  号： 5  ページ： 523-528  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2979A  ISSN： 1000-2618  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 二本鎖リボ核酸(ribonucleicacid,RNA)結合蛋白質(double-strandedRNA-bindingprotein,DRB)は二本鎖RNA結合ドメイン(dsRBD)を含むタンパク質である。小リボ核酸(microribonucleicacid,microRNA或いはmiRNA)の生合成と作用方式の選択において、重要な作用を発揮している。Chlamydomonasreinhardtii(C.reinhardtii)のすべてのCrDRBsの完全長配列を得るために,バイオインフォマティクス分析を行った。dsRBDドメインモジュールを蛋白質機能ドメインPfamデータベースからダウンロードし,C.reinhardtiiの全ゲノム配列をdsRBDにより検索し,Cを得た。reinhardtiiの4つのdsRBDドメインを含むCrDRBタンパク質に関する情報。C.reinhardtii総RNAを抽出し、逆転写し、そのcDNAを獲得し、相応のプライマークローンを設計し、その完全な遺伝子ORF配列を獲得した。リアルタイム蛍光定量的PCRプライマーを設計し,C.reinhardtiiのCrDRBs遺伝子の相対的発現を分析した。C.reinhardtiiのCrDRBs蛋白質のdsRBD配列は,相同配列分析で分析された。dsRBDの高次構造をPhyre2ソフトウェアによってオンラインで予測した。CrDRBsのdsRBDとシロイヌナズナの5つのDRBメンバーを系統樹分析に構築し,CrDRBsの各メンバーの進化的保存性を予備的に解析した。本研究では、4つの菜種クラミドモナスの二本鎖RNA結合タンパク質が得られ、いずれも典型的なdsRBDドメインを持ち、3つの保存アミノ酸を含有している。既報のDUS16と比べ、他の3つのCrDRBsのCDS配列は長く、遺伝子発現は高かった(CrDRB2を除く)。本研究は、次のステップで、クラミドリムシCrDRBがmiRNA制御経路の機能に基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ソフトウェア ,  Arabidopsis thaliana ,  *遺伝子 ,  タンパク質 ,  蛍光 ,  アミノ酸 ,  系統樹 ,  生合成 ,  データベース ,  cDNA ,  遺伝子発現
準シソーラス用語： ドメイン構造 ,  マイクロRNA ,  *バイオインフォマティクス ,  *クローニング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 遺伝子 ,  クローニング ,  バイオインフォマティクス ,  分析