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J-GLOBAL ID：201902216407731689   整理番号：19A0494529

Symplocarpus renifoliusの葉緑体ゲノム:サトイモ科における葉緑体ゲノム構造の比較【JST・京大機械翻訳】

The Chloroplast Genome of Symplocarpus renifolius: A Comparison of Chloroplast Genome Structure in Araceae

著者 (3件)： Choi Kyoung Su (Department of Life Sciences, Yeungnam University, Gyeongsan 712-749, Gyeongsangbuk-do, Korea) ,  Park Kyu Tae (Department of Life Sciences, Yeungnam University, Gyeongsan 712-749, Gyeongsangbuk-do, Korea) ,  Park SeonJoo (Department of Life Sciences, Yeungnam University, Gyeongsan 712-749, Gyeongsangbuk-do, Korea)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 11  ページ： 324  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Symplocarpus renifoliusは,外観が異常に多様なAraceaeファミリーのメンバーである。Araceaeにおける葉緑体ゲノムに関する以前の研究は,アオウキクサ(Lemnoideae)と根の作物(Colocasia,一般的にtaroとして知られている)に焦点を合わせた。ここでは,Symplocarpus renifoliusの葉緑体ゲノムを決定し,遺伝子および逆反復(IR)接合のような因子を比較し,他のAraceae種を用いて系統発生分析を行った。S.renifoliusの葉緑体ゲノムは158,521bpであり,113の遺伝子を含んでいる。Araceae葉緑体ゲノム間の比較により,Lemna,Spirodela,Wolffiella,Wolffia,Dieffenbachia及びColocasiaにおけるinfAは失われており,偽遺伝子になり,Symplocarpusにおいてのみ保持されていることを示した。Araceae葉緑体DNA(cpDNA)において,PsbZは保持されている。しかしながら,PsbZ重複はWolffia種で生じ,タンデム反復は重複領域周辺で認められた。Araceae種におけるIRジャンクションの比較は,小さな単一コピー領域におけるYCF1とrps15の存在を明らかにしたが,一方,アオウキクサ種はIR領域においてYCF1とrps15を含んだ。葉緑体ゲノムの系統発生分析は,Symplocarpusが基礎グループであり,他のAraceae種に対して姉妹であることを明らかにした。結果として,AraceaeにおけるinfA欠失または偽遺伝子イベントは,AraceaeにおけるSymplocarpusおよび水生植物(ウキクサ)の発散後に生じ,rps15およびYCF1の重複事象はIR領域において生じた。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 偽遺伝子 ,  遺伝子 ,  *サトイモ属 ,  系統発生 ,  農作物 ,  サトイモ科 ,  水生植物
準シソーラス用語： 姉妹 ,  Wolffia ,  葉緑体DNA ,  Symplocarpus ,  系統解析 ,  アオウキクサ ,  *葉緑体ゲノム ,  *ザゼンソウ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： サトイモ科 ,  Symplocarpus ,  INFA ,  PSBZ ,  逆反復領域 ,  系統発生関係

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (40件)：

• Grayum, M.H. Evolution and phylogeny of the Araceae. Ann. Mo. Bot. Gard. 1990, 77, 628-697.
• Les, D.H.; Crawford, D.J.; Landolt, E.; Gabel, J.D.; Kimball, R.T. Phylogeny and systematics of Lemnaceae, the duckweed family. Syst. Bot. 2002, 27, 221-240.
• Cusimano, N.; Bogner, J.; Mayo, S.J.; Boyce, P.C.; Wong, S.Y.; Hesse, M.; Hetterscheid, W.L.; Keating, R.C.; French, J.C. Relationships within the Araceae: Comparison of morphological patterns with molecular phylogenies. Am. J. Bot. 2011, 98, 654-668.
• Schott, H.W. Prodromus Systematis Aroidearum; Congretationis Mechitharisticae: Vienna, Austria, 1860.
• Engler, A. Vergleichende Untersuchungen über die morphologischen Verhältnisse der Araceae. I. Natürliches System der Araceae. In Nova Acta Academiae Caesareae Leopino-Carolinae Germanicae Naturae Curiosorum; E. Blochmann & Sohn: Dresden, Germany, 1876; Volume 39, pp. 133-155.

タイトルに関連する用語 (2件)： 葉緑体ゲノム ,  サトイモ科