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J-GLOBAL ID：201902216775676928   整理番号：19A1084273

アブラギリの叢枝病関連lncRNAsの発現と調節【JST・京大機械翻訳】

Expression and regulation of lncRNAs related to Paulownia witches’ broom

著者 (6件)： Li Wenyang (信陽農林学院林学院,河南 信陽,464000) ,  Li Yongsheng (河南農業大学泡桐研究所,河南 鄭州,450002) ,  Cao Yabing (河南農業大学泡桐研究所,河南 鄭州,450002) ,  Wang Zhe (河南農業大学泡桐研究所,河南 鄭州,450002) ,  Yan Lijun (河南農業大学泡桐研究所,河南 鄭州,450002) ,  Fan Guoqiang (河南農業大学泡桐研究所,河南 鄭州,450002)
資料名： Fujian Linxueyuan Xuebao  (Fujian Linxueyuan Xuebao)
巻： 39  号： 2  ページ： 181-187  発行年： 2019年 
JST資料番号： C2391A  ISSN： 1001-389X  CODEN： FLXUE7  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： アブラギリの叢枝病に関連する長鎖非コードRNA(lncRNA)を明らかにするために、その制御モードを検討し、ハイスループットシークエンシングプラットフォームIlluminaHiseqTM2000を用いて、キリの健康苗、枝病苗とリファンピシン処理の叢枝病苗に対してシークエンシングを行った。遺伝子オントロジー(GO)の機能,およびゲノムの百科全書(KEGG)の経路を,遺伝子オントロジー(GO)の機能,および遺伝子オントロジー(KEGG)の濃縮性分析のために,それぞれ選別して,遺伝子オントロジー(GO)および遺伝子オントロジー(GO)を,それぞれ,選択した,そして,遺伝子オントロジー(GO)および遺伝子オントロジー(GO)を,スクリーニングした。結果は以下を示した。全部で同定された3237の候補lncRNAsは、そのうちPT/PTI、PT/PTIL-100とPTI/PTIL-100に差異発現があり、同じlncRNAsは147個あり、標的遺伝子は40個のGOと119個の代謝経路に濃縮された。比較分析を通じて、72個のlncRNAsがアブラギリの叢枝病の発生と関係がある可能性があり、その標的遺伝子が主に関与するKEGG代謝経路には、ホスホリパーゼDシグナル経路、Wntシグナル伝達経路、ABC輸送、グリコシルホスファチジルイノシトール(GPI)-アンカー生合成経路があることが分かった。二次代謝産物の生合成,ユビキチン媒介蛋白質分解,ゼアチン生合成,グリシン,セリン及びトレオニン代謝など。予測lncRNAs(TCONS_009507,TCONS_00019521,TCONS_00012917;TCONS_00030963とTCONS_0002705)は,アブラギリの枝のフィトプラズマとアブラギリの相互作用と細胞周期の変化に影響を及ぼし,そして,キリの枝病発生機構の研究に基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ユビキチン ,  細胞周期 ,  ゲノム ,  二次代謝産物 ,  *生合成 ,  タンパク質分解 ,  代謝経路 ,  相互作用 ,  予測 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸
準シソーラス用語： 生合成経路 ,  標的遺伝子 ,  KEGG ,  遺伝子オントロジー ,  配列解析 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 森林生物学一般  (FF02010T) ,  森林植物学  (FF02020E)

物質索引 (1件)： グリシン

タイトルに関連する用語 (4件)： アブラギリ ,  枝 ,  発現 ,  調節