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J-GLOBAL ID：201902216888191185   整理番号：19A1954866

Lactobacillus helveticus株のゲノム比較はプロバイオティクスの可能性を強調する【JST・京大機械翻訳】

Genomic Comparison of Lactobacillus helveticus Strains Highlights Probiotic Potential

著者 (9件)： Fontana Alessandra (Department for Sustainable Food Process - DiSTAS, Universita Cattolica del Sacro Cuore, Piacenza, Italy) ,  Falasconi Irene (Department for Sustainable Food Process - DiSTAS, Universita Cattolica del Sacro Cuore, Piacenza, Italy) ,  Molinari Paola (Department for Sustainable Food Process - DiSTAS, Universita Cattolica del Sacro Cuore, Piacenza, Italy) ,  Treu Laura (Department of Biology, University of Padua, Padua, Italy) ,  Basile Arianna (Department of Biology, University of Padua, Padua, Italy) ,  Vezzi Alessandro (Department of Biology, University of Padua, Padua, Italy) ,  Campanaro Stefano (Department of Biology, University of Padua, Padua, Italy) ,  Campanaro Stefano (CRIBI Biotechnology Center, University of Padua, Padua, Italy) ,  Morelli Lorenzo (Department for Sustainable Food Process - DiSTAS, Universita Cattolica del Sacro Cuore, Piacenza, Italy)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 1380  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Lactobacillus helveticusは広範囲の食品の発酵における主要なプレーヤーである乳酸菌(LAB)の大きなグループに属する。研究室はヒトの腸にも存在するが,これは潜在的な新しいプロバイオティック株の貯留層としてしばしば利用されてきたが,いくつかのパラメータはヒトの消費に対するそれらの安全性と潜在的な使用を確立する前に評価する必要がある。本研究では,天然ホエー培養から分離された6つのL.helveticus株を,エキソ多糖類(EPS)生産,低pHおよび胆汁酸塩耐性,胆汁酸塩ヒドロラーゼ(BSH)活性および抗生物質耐性プロフィールにおける表現型および遺伝子型について分析した。さらに,比較ゲノム研究を6つの新しく配列した系統と,L.phelveticusの51の公的に利用可能なゲノムの間で行い,パンゲノム構造を定義した。結果は,新しく配列された株UC1267と堆積株DSM20075が,0.2%グリココール酸(GCA)と1%タウロコールとタウロデオキシコール酸(TDCA)の存在下で生存する能力により,gut適応株の良い候補と考えられることを示した。さらに,これらの株は,試験したL.helveticus株の中で最も高い胆汁酸脱抱合活性を有していた。安全性プロフィールを考慮すると,これらの株のいずれも抗生物質耐性表現型および/またはゲノムレベルを示さなかった。パンゲノム解析により,UC1266及びUC1267株における葉酸生合成に関連する酵素及びUC1035株における統合ファージのような新しい分離株に特異的な遺伝子を明らかにした。最終的に,著者らの株におけるマルトース分解酵素と6-ホスホ-β-グルコシダーゼ遺伝子の多重コピーの存在は,ラクトース以外の糖を代謝する能力を示し,それは単に酪農ニッチに関連している。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ゲノム ,  生合成 ,  遺伝子 ,  ヒドロラーゼ ,  *乳酸桿菌属 ,  表現型 ,  遺伝子型 ,  ホエー ,  バクテリオファージ ,  乳酸菌 ,  *プロバイオティクス ,  培養 ,  胆汁酸 ,  ヒト
準シソーラス用語： *Lactobacillus helveticus , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 乳酸菌 ,  Lactobacillus helveticus ,  胆汁酸塩耐性 ,  エキソ多糖類 ,  抗生物質耐性 ,  比較ゲノミクス ,  プロバイオティクス

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物生理一般  (EG03051L)

引用文献 (93件)：

• Alvarez-Sieiro P., Montalbán-López M., Mu D., Kuipers O. P. (2016). Bacteriocins of lactic acid bacteria: extending the family. Appl. Microbiol. Biotechnol. 100 2939-2951. doi: 10.1007/s00253-016-7343-9
• Antipov D., Hartwick N., Shen M., Raiko M., Lapidus A., Pevzner P. A. (2016). PlasmidSPAdes: assembling plasmids from whole genome sequencing data. Bioinformatics 32 3380-3387. doi: 10.1093/bioinformatics/btw493
• Arndt D., Grant J. R., Marcu A., Sajed T., Pon A., Liang Y., et al (2016). PHASTER: a better, faster version of the PHAST phage search tool. Nucleic Acids Res 44 W16-W21. doi: 10.1093/nar/gkw387
• Åvall-Jääskeläinen S., Palva A. (2005). Lactobacillus surface layers and their applications. FEMS Microbiol. Rev. 29 511-529. doi: 10.1016/j.femsre.2005.04.003
• Barreto M., Jedlicki E., Holmes D. S. (2005). Identification of a gene cluster for the formation of extracellular polysaccharide precursors in the chemolithoautotroph Acidithiobacillus ferrooxidans. Appl. Environ. Microbiol. 71 2902-2909. doi: 10.1128/AEM.71.6.2902-2909.2005

タイトルに関連する用語 (5件)： Lactobacillus ,  株 ,  ゲノム ,  プロバイオティクス ,  可能性