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J-GLOBAL ID：201902216918598581   整理番号：19A2041645

E3ユビキチンリガーゼと基質相互作用ネットワークの多次元特性化【JST・京大機械翻訳】

A Multidimensional Characterization of E3 Ubiquitin Ligase and Substrate Interaction Network

著者 (16件)： Chen Di (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  Liu Xiaolong (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  Xia Tian (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  Tekcham Dinesh Singh (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  Wang Wen (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  Chen Huan (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  Li Tongming (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  Lu Chang (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  Lu Chang (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Dalian Medical University, Dalian Medical University, Dalian 116000, China) ,  Ning Zhen (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  Ning Zhen (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Dalian Medical University, Dalian Medical University, Dalian 116000, China) ,  Liu Xiumei (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  Liu Jing (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  Qi Huan (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China) ,  He Hui (Department of Hepatobiliary Surgery, The First Affiliated Hospital of Dalian Medical University, Dalian Medical University, Dalian 116000, China) ,  Piao Hai-long (CAS Key Laboratory of Separation Science for Analytical Chemistry, Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, China)
資料名： iScience  (iScience)
巻： 16  ページ： 177-191  発行年： 2019年 
JST資料番号： W5512A  ISSN： 2589-0042  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： E3ユビキチンリガーゼ(E3s)は,分子および細胞機構において重要な役割を果たしている。しかしながら,多数のE3-基質相互作用(ESI)は明らかになっていない。ここでは,ESIを特性化し同定するために,生物学的知識により増加するオミクスデータを統合した。ESIの関連パターンを得るために多次元特徴を計算し,ESIを同定するためにアンサンブル予測モデルを構築した。非ESI事例との比較は,ESI解釈に対する意味のある洞察を提供する,ESIsの特異的会合パターンを明らかにした。予測モデルの信頼性を種々の観点から確認した。特に,Fボックス(fbxl)ファミリーのロイシンに富む反復ファミリーに関する著者らの評価はプロテオミクス研究と一致し,SKP2およびオーファンE3 FBXL6に対するいくつかの基質が実験的に検証された。さらに,癌の特徴的なESI景観を研究した。まとめると,著者らの研究は,omics駆動ESI関連パターンにおけるグリmpを捉え,ユビキチン化研究を支援するための価値ある資源(http://www.esinet.dicp.ac.cn/home.php)を提供する。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 予測モデル ,  *基質 ,  *キャラクタリゼーション ,  *ネットワーク ,  *高次元 ,  プロテオミクス ,  アンサンブル予報 ,  ユビキチン化 ,  信頼性 ,  送風機 ,  *相互作用 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  分枝鎖アミノ酸
準シソーラス用語： オミックス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 分子ネットワーク ,  バイオインフォマティクス ,  システム生物学 ,  プロテオミクス

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

物質索引 (1件)： ロイシン

タイトルに関連する用語 (5件)： E3ユビキチンリガーゼ ,  基質 ,  相互作用 ,  多次元 ,  特性化