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J-GLOBAL ID：201902217302738307   整理番号：19A1726799

肥満ラットのRoux-en-Y胃バイパス術による体重減少後の脂肪組織差異遺伝子発現のバイオインフォマティクス分析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis of differentially expressed genes in adipose tissue of obese SD rats after Roux-en-Y gastric bypass surgery

著者 (6件)： Shen Jing (山西医科大学生理学系,太原 030001;細胞生理学教育部重点実験室) ,  Miao Junqiu (山西医科大学薬学院薬物化学教研室) ,  Gao Lijuan (山西医科大学生理学系,太原 030001;細胞生理学教育部重点実験室) ,  Wang Deping (山西医科大学生理学系,太原 030001;細胞生理学教育部重点実験室) ,  Zuo Lin (山西医科大学生理学系,太原 030001;細胞生理学教育部重点実験室) ,  Cao Jimin (山西医科大学生理学系,太原 030001;細胞生理学教育部重点実験室)
資料名： Shanxiyike Daxue Xuebao  (Shanxiyike Daxue Xuebao)
巻： 50  号： 4  ページ： 433-438  発行年： 2019年 
JST資料番号： C3514A  ISSN： 1007-6611  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】肥満関連遺伝子マイクロアレイのバイオインフォマティクス分析を通して,肥満治療の新しいターゲットを調査する。方法:遺伝子発現データベース(GEO)からRoux-en-Y減量手術(RYGB)前後の肥満Sprague-Dawley(SD)ラットの脂肪組織関連遺伝子発現プロファイルデータGSE8314をダウンロードした。R言語を用いて差異遺伝子を選別し、DAVIDデータベースを用いて、差異遺伝子に対してGOとKEGGpathwayの濃縮分析を行い、STRINGオンラインツールを用いてPPIネットワークの構築を行った。結果:890個のRYGB術前後SDラットの脂肪組織差次的発現遺伝子を選別し、そのうち、386個をアップレギュレーションし、504個をダウンレギュレーションした。GO分析によると、これらの差異遺伝子は25個の生物学的過程、3つの分子機能、12個の細胞成分に参与する。KEGGpathway濃縮分析により、これらの差異遺伝子は主にタンパク質消化吸収(rno04974)、シトクロムP450による生体異物の代謝(rno00980)に関与することが分かった。薬物代謝-チトクロームP450(rno00982)、アラキドン酸代謝(rno00590)、アディポサイトカインシグナル経路(rno04920)など。STRINGオンラインツール分析を用いて、これらの差異遺伝子コードのタンパク質は相互作用があることが分かった。Bdkrb1,Ccl6,Pf4は蛋白質-蛋白質相互作用ネットワークにおけるコアノードである。【結語】GSE8314マイクロアレイデータのマイニングにより,RYGB後のSDラットの脂肪組織の遺伝子発現は,明らかに異なり,肥満に密接に関連する遺伝子Bdkrb1,PF4を選別し,後者は肥満の薬理学的治療標的になる可能性がある。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  アディポカイン ,  *脂肪組織 ,  相互作用 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  *遺伝子発現 ,  *遺伝子 ,  データベース ,  *ラット ,  *肥満 ,  差次的遺伝子発現 ,  マイクロアレイ ,  *バイオインフォマティクス ,  R言語 ,  *分子遺伝現象 ,  *ネズミ亜目
準シソーラス用語： Rパッケージ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： GEO database ,  bioinformatics ,  obesity ,  Roux-en-Y gastric bypass

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (9件)： 肥満 ,  ラット ,  Roux-en-Y胃バイパス術 ,  体重減少 ,  脂肪組織 ,  差異 ,  遺伝子発現 ,  バイオインフォマティクス ,  分析