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J-GLOBAL ID:201902217838614365   整理番号:19A2363646

動的摂動ネットワークによるV型酵素のアロステリック経路の探索【JST・京大機械翻訳】

Exploring Allosteric Pathways of a V-Type Enzyme with Dynamical Perturbation Networks
著者 (10件):
資料名:
巻: 123  号: 16  ページ: 3452-3461  発行年: 2019年 
JST資料番号: W0921A  ISSN: 1520-6106  CODEN: JPCBFK  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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蛋白質におけるアロステリック経路の解明は,グラフ理論に基づく化学的相互作用の複雑な動的ネットワークの原子論的分子動力学(MD)シミュレーションと粗粒解析の組合せから強く利益を得る計算上の挑戦である。ここでは,プロトタイプV型アロステリック酵素におけるアロステリック経路の動的摂動ネットワーク解析の性能を紹介し評価した。MDシミュレーションから得られた動的原子接触を用いてアロステリック蛋白質グラフを重み付けした。これはアロステリック部位におけるエフェクタ結合により摂動された接触の拡張ネットワークを含む。結果は以前に報告された理論的および実験的拡張研究と良い一致を示し,将来の変異誘発実験に利用できる新しい潜在的アロステリックスポットの認識を提供した。全体として,動的摂動ネットワーク解析は,蛋白質工学および合理的な薬物設計における進歩のためのアロステリック現象の完全な開発を支援できる他のネットワークに基づくアプローチに相補的な強力な計算ツールであることが証明された。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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